Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

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Length 1,013 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Phf20l1Q8CCJ9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Phf20l1Q8CCJ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Phf20l1Q8CCJ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Phf20l1Q8CCJ9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Phf20l1Q8CCJ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Phf20l1Q8CCJ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Phf20l1Q8CCJ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Phf20l1Q8CCJ9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Phf20l1Q8CCJ9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Phf20l1Q8CCJ9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Phf20l1Q8CCJ9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Phf20l1Q8CCJ9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Phf20l1Q8CCJ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Phf20l1Q8CCJ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Phf20l1Q8CCJ9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Phf20l1Q8CCJ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Phf20l1Q8CCJ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Phf20l1Q8CCJ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Phf20l1Q8CCJ9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Phf20l1Q8CCJ9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Phf20l1Q8CCJ9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Phf20l1Q8CCJ9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Phf20l1Q8CCJ9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Phf20l1Q8CCJ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Phf20l1Q8CCJ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Phf20l1Q8CCJ9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Phf20l1Q8CCJ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Phf20l1Q8CCJ9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Phf20l1Q8CCJ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Phf20l1Q8CCJ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Phf20l1Q8CCJ9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Phf20l1Q8CCJ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Phf20l1Q8CCJ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Phf20l1Q8CCJ9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Phf20l1Q8CCJ9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Phf20l1Q8CCJ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Phf20l1Q8CCJ9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Phf20l1Q8CCJ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Phf20l1Q8CCJ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Phf20l1Q8CCJ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Phf20l1Q8CCJ9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Phf20l1Q8CCJ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Phf20l1Q8CCJ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Phf20l1Q8CCJ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Phf20l1Q8CCJ9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Phf20l1Q8CCJ9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Phf20l1Q8CCJ9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Phf20l1Q8CCJ9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Phf20l1Q8CCJ9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Phf20l1Q8CCJ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Phf20l1Q8CCJ9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Phf20l1Q8CCJ9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Phf20l1Q8CCJ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Phf20l1Q8CCJ9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Phf20l1Q8CCJ9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Phf20l1Q8CCJ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Phf20l1Q8CCJ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Phf20l1Q8CCJ9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Phf20l1Q8CCJ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Phf20l1Q8CCJ9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Phf20l1Q8CCJ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Phf20l1Q8CCJ9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Phf20l1Q8CCJ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Phf20l1Q8CCJ9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Phf20l1Q8CCJ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Phf20l1Q8CCJ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Phf20l1Q8CCJ9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Phf20l1Q8CCJ9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Phf20l1Q8CCJ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Phf20l1Q8CCJ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Phf20l1Q8CCJ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Phf20l1Q8CCJ9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Phf20l1Q8CCJ9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Phf20l1Q8CCJ9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Phf20l1Q8CCJ9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Phf20l1Q8CCJ9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Phf20l1Q8CCJ9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Phf20l1Q8CCJ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Phf20l1Q8CCJ9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Phf20l1Q8CCJ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Phf20l1Q8CCJ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Phf20l1Q8CCJ9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Phf20l1Q8CCJ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Phf20l1Q8CCJ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Phf20l1Q8CCJ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Phf20l1Q8CCJ9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Phf20l1Q8CCJ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Phf20l1Q8CCJ9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Phf20l1Q8CCJ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Phf20l1Q8CCJ9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Phf20l1Q8CCJ9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Phf20l1Q8CCJ9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Phf20l1Q8CCJ9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Phf20l1Q8CCJ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Phf20l1Q8CCJ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Phf20l1Q8CCJ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Phf20l1Q8CCJ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Phf20l1Q8CCJ9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
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