Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RPAINQ86UA6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RPAINQ86UA6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPAINQ86UA6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPAINQ86UA6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPAINQ86UA6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPAINQ86UA6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPAINQ86UA6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RPAINQ86UA6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPAINQ86UA6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RPAINQ86UA6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPAINQ86UA6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPAINQ86UA6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPAINQ86UA6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RPAINQ86UA6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPAINQ86UA6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPAINQ86UA6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPAINQ86UA6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPAINQ86UA6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPAINQ86UA6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RPAINQ86UA6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPAINQ86UA6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPAINQ86UA6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPAINQ86UA6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPAINQ86UA6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPAINQ86UA6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RPAINQ86UA6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPAINQ86UA6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPAINQ86UA6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RPAINQ86UA6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPAINQ86UA6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPAINQ86UA6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPAINQ86UA6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPAINQ86UA6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPAINQ86UA6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RPAINQ86UA6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPAINQ86UA6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPAINQ86UA6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPAINQ86UA6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPAINQ86UA6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPAINQ86UA6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPAINQ86UA6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPAINQ86UA6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPAINQ86UA6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPAINQ86UA6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPAINQ86UA6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPAINQ86UA6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPAINQ86UA6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPAINQ86UA6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RPAINQ86UA6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPAINQ86UA6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPAINQ86UA6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPAINQ86UA6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RPAINQ86UA6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPAINQ86UA6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RPAINQ86UA6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPAINQ86UA6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPAINQ86UA6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RPAINQ86UA6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RPAINQ86UA6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RPAINQ86UA6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RPAINQ86UA6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RPAINQ86UA6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPAINQ86UA6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RPAINQ86UA6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPAINQ86UA6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPAINQ86UA6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RPAINQ86UA6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RPAINQ86UA6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPAINQ86UA6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPAINQ86UA6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPAINQ86UA6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPAINQ86UA6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RPAINQ86UA6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RPAINQ86UA6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPAINQ86UA6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPAINQ86UA6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPAINQ86UA6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAINQ86UA6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAINQ86UA6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAINQ86UA6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RPAINQ86UA6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAINQ86UA6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAINQ86UA6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RPAINQ86UA6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPAINQ86UA6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RPAINQ86UA6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPAINQ86UA6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RPAINQ86UA6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RPAINQ86UA6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAINQ86UA6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAINQ86UA6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAINQ86UA6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RPAINQ86UA6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPAINQ86UA6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPAINQ86UA6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RPAINQ86UA6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPAINQ86UA6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPAINQ86UA6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RPAINQ86UA6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms