Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PhkbQ7TSH2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PhkbQ7TSH2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PhkbQ7TSH2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PhkbQ7TSH2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PhkbQ7TSH2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PhkbQ7TSH2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PhkbQ7TSH2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PhkbQ7TSH2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PhkbQ7TSH2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PhkbQ7TSH2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PhkbQ7TSH2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PhkbQ7TSH2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PhkbQ7TSH2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PhkbQ7TSH2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PhkbQ7TSH2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PhkbQ7TSH2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PhkbQ7TSH2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PhkbQ7TSH2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PhkbQ7TSH2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PhkbQ7TSH2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PhkbQ7TSH2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PhkbQ7TSH2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PhkbQ7TSH2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PhkbQ7TSH2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PhkbQ7TSH2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PhkbQ7TSH2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PhkbQ7TSH2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PhkbQ7TSH2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PhkbQ7TSH2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PhkbQ7TSH2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PhkbQ7TSH2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PhkbQ7TSH2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PhkbQ7TSH2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PhkbQ7TSH2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PhkbQ7TSH2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PhkbQ7TSH2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PhkbQ7TSH2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PhkbQ7TSH2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PhkbQ7TSH2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PhkbQ7TSH2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PhkbQ7TSH2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PhkbQ7TSH2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PhkbQ7TSH2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PhkbQ7TSH2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PhkbQ7TSH2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PhkbQ7TSH2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PhkbQ7TSH2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PhkbQ7TSH2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PhkbQ7TSH2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PhkbQ7TSH2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PhkbQ7TSH2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PhkbQ7TSH2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PhkbQ7TSH2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PhkbQ7TSH2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PhkbQ7TSH2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PhkbQ7TSH2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PhkbQ7TSH2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PhkbQ7TSH2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PhkbQ7TSH2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PhkbQ7TSH2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PhkbQ7TSH2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PhkbQ7TSH2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PhkbQ7TSH2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PhkbQ7TSH2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PhkbQ7TSH2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PhkbQ7TSH2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PhkbQ7TSH2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PhkbQ7TSH2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PhkbQ7TSH2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PhkbQ7TSH2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PhkbQ7TSH2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PhkbQ7TSH2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PhkbQ7TSH2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PhkbQ7TSH2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PhkbQ7TSH2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PhkbQ7TSH2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PhkbQ7TSH2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PhkbQ7TSH2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PhkbQ7TSH2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PhkbQ7TSH2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PhkbQ7TSH2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PhkbQ7TSH2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PhkbQ7TSH2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PhkbQ7TSH2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PhkbQ7TSH2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PhkbQ7TSH2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PhkbQ7TSH2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PhkbQ7TSH2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PhkbQ7TSH2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PhkbQ7TSH2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PhkbQ7TSH2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PhkbQ7TSH2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PhkbQ7TSH2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PhkbQ7TSH2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PhkbQ7TSH2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PhkbQ7TSH2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PhkbQ7TSH2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PhkbQ7TSH2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PhkbQ7TSH2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms