Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sox11Q7M6Y2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox11Q7M6Y2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sox11Q7M6Y2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sox11Q7M6Y2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox11Q7M6Y2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sox11Q7M6Y2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox11Q7M6Y2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox11Q7M6Y2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox11Q7M6Y2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sox11Q7M6Y2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox11Q7M6Y2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox11Q7M6Y2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sox11Q7M6Y2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sox11Q7M6Y2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sox11Q7M6Y2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox11Q7M6Y2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox11Q7M6Y2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sox11Q7M6Y2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox11Q7M6Y2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sox11Q7M6Y2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox11Q7M6Y2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox11Q7M6Y2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sox11Q7M6Y2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sox11Q7M6Y2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox11Q7M6Y2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox11Q7M6Y2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sox11Q7M6Y2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox11Q7M6Y2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sox11Q7M6Y2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox11Q7M6Y2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox11Q7M6Y2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sox11Q7M6Y2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox11Q7M6Y2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox11Q7M6Y2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sox11Q7M6Y2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sox11Q7M6Y2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox11Q7M6Y2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sox11Q7M6Y2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox11Q7M6Y2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox11Q7M6Y2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sox11Q7M6Y2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox11Q7M6Y2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sox11Q7M6Y2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox11Q7M6Y2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox11Q7M6Y2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox11Q7M6Y2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sox11Q7M6Y2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox11Q7M6Y2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sox11Q7M6Y2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox11Q7M6Y2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sox11Q7M6Y2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sox11Q7M6Y2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sox11Q7M6Y2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sox11Q7M6Y2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sox11Q7M6Y2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox11Q7M6Y2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sox11Q7M6Y2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox11Q7M6Y2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sox11Q7M6Y2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sox11Q7M6Y2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox11Q7M6Y2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sox11Q7M6Y2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox11Q7M6Y2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sox11Q7M6Y2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sox11Q7M6Y2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sox11Q7M6Y2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sox11Q7M6Y2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox11Q7M6Y2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sox11Q7M6Y2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sox11Q7M6Y2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms