Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ58

Larp1, La-related protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1Q6ZQ58 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Larp1Q6ZQ58 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Larp1Q6ZQ58 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Larp1Q6ZQ58 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Larp1Q6ZQ58 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Larp1Q6ZQ58 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Larp1Q6ZQ58 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Larp1Q6ZQ58 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Larp1Q6ZQ58 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Larp1Q6ZQ58 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Larp1Q6ZQ58 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Larp1Q6ZQ58 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Larp1Q6ZQ58 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Larp1Q6ZQ58 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Larp1Q6ZQ58 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Larp1Q6ZQ58 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Larp1Q6ZQ58 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Larp1Q6ZQ58 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Larp1Q6ZQ58 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Larp1Q6ZQ58 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Larp1Q6ZQ58 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Larp1Q6ZQ58 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Larp1Q6ZQ58 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Larp1Q6ZQ58 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Larp1Q6ZQ58 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Larp1Q6ZQ58 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Larp1Q6ZQ58 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Larp1Q6ZQ58 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Larp1Q6ZQ58 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Larp1Q6ZQ58 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Larp1Q6ZQ58 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Larp1Q6ZQ58 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Larp1Q6ZQ58 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Larp1Q6ZQ58 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Larp1Q6ZQ58 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Larp1Q6ZQ58 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Larp1Q6ZQ58 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Larp1Q6ZQ58 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Larp1Q6ZQ58 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Larp1Q6ZQ58 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Larp1Q6ZQ58 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Larp1Q6ZQ58 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Larp1Q6ZQ58 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Larp1Q6ZQ58 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Larp1Q6ZQ58 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Larp1Q6ZQ58 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Larp1Q6ZQ58 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Larp1Q6ZQ58 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Larp1Q6ZQ58 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Larp1Q6ZQ58 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Larp1Q6ZQ58 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Larp1Q6ZQ58 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Larp1Q6ZQ58 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Larp1Q6ZQ58 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Larp1Q6ZQ58 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Larp1Q6ZQ58 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Larp1Q6ZQ58 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Larp1Q6ZQ58 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Larp1Q6ZQ58 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Larp1Q6ZQ58 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Larp1Q6ZQ58 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Larp1Q6ZQ58 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Larp1Q6ZQ58 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Larp1Q6ZQ58 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Larp1Q6ZQ58 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Larp1Q6ZQ58 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Larp1Q6ZQ58 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Larp1Q6ZQ58 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Larp1Q6ZQ58 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Larp1Q6ZQ58 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Larp1Q6ZQ58 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Larp1Q6ZQ58 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Larp1Q6ZQ58 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Larp1Q6ZQ58 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Larp1Q6ZQ58 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Larp1Q6ZQ58 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Larp1Q6ZQ58 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Larp1Q6ZQ58 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Larp1Q6ZQ58 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Larp1Q6ZQ58 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Larp1Q6ZQ58 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Larp1Q6ZQ58 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Larp1Q6ZQ58 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Larp1Q6ZQ58 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Larp1Q6ZQ58 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Larp1Q6ZQ58 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Larp1Q6ZQ58 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Larp1Q6ZQ58 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Larp1Q6ZQ58 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Larp1Q6ZQ58 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Larp1Q6ZQ58 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Larp1Q6ZQ58 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Larp1Q6ZQ58 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Larp1Q6ZQ58 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Larp1Q6ZQ58 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Larp1Q6ZQ58 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Larp1Q6ZQ58 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Larp1Q6ZQ58 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Larp1Q6ZQ58 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Larp1Q6ZQ58 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms