Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY53

AY358078, HN1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY358078Q6UY53 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AY358078Q6UY53 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AY358078Q6UY53 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AY358078Q6UY53 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AY358078Q6UY53 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
AY358078Q6UY53 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AY358078Q6UY53 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AY358078Q6UY53 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AY358078Q6UY53 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AY358078Q6UY53 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AY358078Q6UY53 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AY358078Q6UY53 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AY358078Q6UY53 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AY358078Q6UY53 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AY358078Q6UY53 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AY358078Q6UY53 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AY358078Q6UY53 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AY358078Q6UY53 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AY358078Q6UY53 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AY358078Q6UY53 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AY358078Q6UY53 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AY358078Q6UY53 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AY358078Q6UY53 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AY358078Q6UY53 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AY358078Q6UY53 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AY358078Q6UY53 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AY358078Q6UY53 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AY358078Q6UY53 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AY358078Q6UY53 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AY358078Q6UY53 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AY358078Q6UY53 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AY358078Q6UY53 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AY358078Q6UY53 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AY358078Q6UY53 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AY358078Q6UY53 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AY358078Q6UY53 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AY358078Q6UY53 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AY358078Q6UY53 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AY358078Q6UY53 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AY358078Q6UY53 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AY358078Q6UY53 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AY358078Q6UY53 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AY358078Q6UY53 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AY358078Q6UY53 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AY358078Q6UY53 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AY358078Q6UY53 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AY358078Q6UY53 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AY358078Q6UY53 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AY358078Q6UY53 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AY358078Q6UY53 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AY358078Q6UY53 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AY358078Q6UY53 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AY358078Q6UY53 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AY358078Q6UY53 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AY358078Q6UY53 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AY358078Q6UY53 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AY358078Q6UY53 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AY358078Q6UY53 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AY358078Q6UY53 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AY358078Q6UY53 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AY358078Q6UY53 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AY358078Q6UY53 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AY358078Q6UY53 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AY358078Q6UY53 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AY358078Q6UY53 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AY358078Q6UY53 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AY358078Q6UY53 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AY358078Q6UY53 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AY358078Q6UY53 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AY358078Q6UY53 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AY358078Q6UY53 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AY358078Q6UY53 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AY358078Q6UY53 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AY358078Q6UY53 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AY358078Q6UY53 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AY358078Q6UY53 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AY358078Q6UY53 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AY358078Q6UY53 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AY358078Q6UY53 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms