Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tcaf3Q6QR59 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tcaf3Q6QR59 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcaf3Q6QR59 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcaf3Q6QR59 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcaf3Q6QR59 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcaf3Q6QR59 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcaf3Q6QR59 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tcaf3Q6QR59 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tcaf3Q6QR59 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tcaf3Q6QR59 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tcaf3Q6QR59 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tcaf3Q6QR59 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcaf3Q6QR59 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tcaf3Q6QR59 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tcaf3Q6QR59 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tcaf3Q6QR59 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tcaf3Q6QR59 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tcaf3Q6QR59 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tcaf3Q6QR59 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tcaf3Q6QR59 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tcaf3Q6QR59 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tcaf3Q6QR59 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tcaf3Q6QR59 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Tcaf3Q6QR59 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tcaf3Q6QR59 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tcaf3Q6QR59 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tcaf3Q6QR59 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tcaf3Q6QR59 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tcaf3Q6QR59 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tcaf3Q6QR59 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Tcaf3Q6QR59 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tcaf3Q6QR59 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tcaf3Q6QR59 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcaf3Q6QR59 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcaf3Q6QR59 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tcaf3Q6QR59 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcaf3Q6QR59 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcaf3Q6QR59 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tcaf3Q6QR59 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tcaf3Q6QR59 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tcaf3Q6QR59 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tcaf3Q6QR59 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tcaf3Q6QR59 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tcaf3Q6QR59 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tcaf3Q6QR59 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tcaf3Q6QR59 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tcaf3Q6QR59 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tcaf3Q6QR59 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tcaf3Q6QR59 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tcaf3Q6QR59 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tcaf3Q6QR59 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tcaf3Q6QR59 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tcaf3Q6QR59 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tcaf3Q6QR59 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tcaf3Q6QR59 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tcaf3Q6QR59 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tcaf3Q6QR59 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Tcaf3Q6QR59 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tcaf3Q6QR59 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tcaf3Q6QR59 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tcaf3Q6QR59 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tcaf3Q6QR59 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tcaf3Q6QR59 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tcaf3Q6QR59 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tcaf3Q6QR59 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tcaf3Q6QR59 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tcaf3Q6QR59 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tcaf3Q6QR59 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tcaf3Q6QR59 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tcaf3Q6QR59 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tcaf3Q6QR59 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tcaf3Q6QR59 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tcaf3Q6QR59 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tcaf3Q6QR59 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tcaf3Q6QR59 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tcaf3Q6QR59 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tcaf3Q6QR59 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tcaf3Q6QR59 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tcaf3Q6QR59 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tcaf3Q6QR59 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tcaf3Q6QR59 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tcaf3Q6QR59 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tcaf3Q6QR59 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tcaf3Q6QR59 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tcaf3Q6QR59 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tcaf3Q6QR59 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tcaf3Q6QR59 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tcaf3Q6QR59 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tcaf3Q6QR59 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tcaf3Q6QR59 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tcaf3Q6QR59 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Tcaf3Q6QR59 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tcaf3Q6QR59 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tcaf3Q6QR59 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tcaf3Q6QR59 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tcaf3Q6QR59 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tcaf3Q6QR59 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tcaf3Q6QR59 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tcaf3Q6QR59 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms