Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmeff1Q6PFE7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmeff1Q6PFE7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmeff1Q6PFE7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmeff1Q6PFE7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmeff1Q6PFE7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmeff1Q6PFE7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmeff1Q6PFE7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmeff1Q6PFE7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmeff1Q6PFE7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmeff1Q6PFE7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmeff1Q6PFE7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmeff1Q6PFE7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmeff1Q6PFE7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmeff1Q6PFE7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmeff1Q6PFE7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmeff1Q6PFE7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmeff1Q6PFE7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmeff1Q6PFE7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmeff1Q6PFE7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmeff1Q6PFE7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmeff1Q6PFE7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmeff1Q6PFE7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmeff1Q6PFE7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tmeff1Q6PFE7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmeff1Q6PFE7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmeff1Q6PFE7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmeff1Q6PFE7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmeff1Q6PFE7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmeff1Q6PFE7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmeff1Q6PFE7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmeff1Q6PFE7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmeff1Q6PFE7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmeff1Q6PFE7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmeff1Q6PFE7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmeff1Q6PFE7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmeff1Q6PFE7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmeff1Q6PFE7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmeff1Q6PFE7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmeff1Q6PFE7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmeff1Q6PFE7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmeff1Q6PFE7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmeff1Q6PFE7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmeff1Q6PFE7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmeff1Q6PFE7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmeff1Q6PFE7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmeff1Q6PFE7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmeff1Q6PFE7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmeff1Q6PFE7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmeff1Q6PFE7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmeff1Q6PFE7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmeff1Q6PFE7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmeff1Q6PFE7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmeff1Q6PFE7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmeff1Q6PFE7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmeff1Q6PFE7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmeff1Q6PFE7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmeff1Q6PFE7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmeff1Q6PFE7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmeff1Q6PFE7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmeff1Q6PFE7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmeff1Q6PFE7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmeff1Q6PFE7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmeff1Q6PFE7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmeff1Q6PFE7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmeff1Q6PFE7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmeff1Q6PFE7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmeff1Q6PFE7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmeff1Q6PFE7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmeff1Q6PFE7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmeff1Q6PFE7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmeff1Q6PFE7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmeff1Q6PFE7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmeff1Q6PFE7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmeff1Q6PFE7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmeff1Q6PFE7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmeff1Q6PFE7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmeff1Q6PFE7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmeff1Q6PFE7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmeff1Q6PFE7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmeff1Q6PFE7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmeff1Q6PFE7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmeff1Q6PFE7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmeff1Q6PFE7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmeff1Q6PFE7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmeff1Q6PFE7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmeff1Q6PFE7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmeff1Q6PFE7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmeff1Q6PFE7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmeff1Q6PFE7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmeff1Q6PFE7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms