Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
JMJD6Q6NYC1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
JMJD6Q6NYC1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
JMJD6Q6NYC1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
JMJD6Q6NYC1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
JMJD6Q6NYC1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
JMJD6Q6NYC1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
JMJD6Q6NYC1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
JMJD6Q6NYC1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
JMJD6Q6NYC1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
JMJD6Q6NYC1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
JMJD6Q6NYC1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
JMJD6Q6NYC1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
JMJD6Q6NYC1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
JMJD6Q6NYC1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
JMJD6Q6NYC1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
JMJD6Q6NYC1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JMJD6Q6NYC1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JMJD6Q6NYC1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
JMJD6Q6NYC1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
JMJD6Q6NYC1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
JMJD6Q6NYC1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
JMJD6Q6NYC1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
JMJD6Q6NYC1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JMJD6Q6NYC1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
JMJD6Q6NYC1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JMJD6Q6NYC1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
JMJD6Q6NYC1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
JMJD6Q6NYC1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
JMJD6Q6NYC1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
JMJD6Q6NYC1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
JMJD6Q6NYC1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
JMJD6Q6NYC1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
JMJD6Q6NYC1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
JMJD6Q6NYC1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
JMJD6Q6NYC1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
JMJD6Q6NYC1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
JMJD6Q6NYC1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
JMJD6Q6NYC1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
JMJD6Q6NYC1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
JMJD6Q6NYC1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
JMJD6Q6NYC1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
JMJD6Q6NYC1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
JMJD6Q6NYC1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
JMJD6Q6NYC1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
JMJD6Q6NYC1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
JMJD6Q6NYC1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
JMJD6Q6NYC1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
JMJD6Q6NYC1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
JMJD6Q6NYC1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
JMJD6Q6NYC1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
JMJD6Q6NYC1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
JMJD6Q6NYC1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
JMJD6Q6NYC1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
JMJD6Q6NYC1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
JMJD6Q6NYC1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
JMJD6Q6NYC1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
JMJD6Q6NYC1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
JMJD6Q6NYC1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
JMJD6Q6NYC1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
JMJD6Q6NYC1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
JMJD6Q6NYC1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
JMJD6Q6NYC1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms