Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tpd52Q62393 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tpd52Q62393 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tpd52Q62393 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tpd52Q62393 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tpd52Q62393 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Tpd52Q62393 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tpd52Q62393 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tpd52Q62393 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tpd52Q62393 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tpd52Q62393 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tpd52Q62393 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tpd52Q62393 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tpd52Q62393 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Tpd52Q62393 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tpd52Q62393 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tpd52Q62393 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tpd52Q62393 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tpd52Q62393 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tpd52Q62393 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tpd52Q62393 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tpd52Q62393 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tpd52Q62393 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tpd52Q62393 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tpd52Q62393 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpd52Q62393 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpd52Q62393 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpd52Q62393 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpd52Q62393 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tpd52Q62393 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tpd52Q62393 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tpd52Q62393 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tpd52Q62393 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tpd52Q62393 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tpd52Q62393 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tpd52Q62393 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tpd52Q62393 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tpd52Q62393 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tpd52Q62393 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tpd52Q62393 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tpd52Q62393 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tpd52Q62393 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tpd52Q62393 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tpd52Q62393 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Tpd52Q62393 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tpd52Q62393 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tpd52Q62393 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Tpd52Q62393 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tpd52Q62393 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tpd52Q62393 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tpd52Q62393 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tpd52Q62393 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tpd52Q62393 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tpd52Q62393 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tpd52Q62393 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tpd52Q62393 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Tpd52Q62393 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tpd52Q62393 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tpd52Q62393 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tpd52Q62393 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tpd52Q62393 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tpd52Q62393 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tpd52Q62393 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tpd52Q62393 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tpd52Q62393 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tpd52Q62393 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tpd52Q62393 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tpd52Q62393 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tpd52Q62393 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tpd52Q62393 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Tpd52Q62393 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tpd52Q62393 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tpd52Q62393 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tpd52Q62393 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tpd52Q62393 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tpd52Q62393 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tpd52Q62393 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tpd52Q62393 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tpd52Q62393 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tpd52Q62393 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tpd52Q62393 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tpd52Q62393 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpd52Q62393 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpd52Q62393 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tpd52Q62393 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tpd52Q62393 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tpd52Q62393 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tpd52Q62393 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tpd52Q62393 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tpd52Q62393 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tpd52Q62393 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tpd52Q62393 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tpd52Q62393 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tpd52Q62393 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tpd52Q62393 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tpd52Q62393 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tpd52Q62393 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tpd52Q62393 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tpd52Q62393 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tpd52Q62393 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms