Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Akap4Q60662 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Akap4Q60662 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Akap4Q60662 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Akap4Q60662 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Akap4Q60662 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Akap4Q60662 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Akap4Q60662 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Akap4Q60662 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Akap4Q60662 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Akap4Q60662 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Akap4Q60662 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Akap4Q60662 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Akap4Q60662 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Akap4Q60662 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Akap4Q60662 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Akap4Q60662 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Akap4Q60662 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Akap4Q60662 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Akap4Q60662 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Akap4Q60662 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Akap4Q60662 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Akap4Q60662 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Akap4Q60662 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Akap4Q60662 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Akap4Q60662 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Akap4Q60662 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Akap4Q60662 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Akap4Q60662 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Akap4Q60662 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Akap4Q60662 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Akap4Q60662 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Akap4Q60662 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Akap4Q60662 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Akap4Q60662 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Akap4Q60662 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Akap4Q60662 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Akap4Q60662 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Akap4Q60662 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Akap4Q60662 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Akap4Q60662 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Akap4Q60662 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Akap4Q60662 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Akap4Q60662 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Akap4Q60662 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Akap4Q60662 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Akap4Q60662 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Akap4Q60662 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Akap4Q60662 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Akap4Q60662 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Akap4Q60662 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Akap4Q60662 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Akap4Q60662 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Akap4Q60662 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Akap4Q60662 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Akap4Q60662 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Akap4Q60662 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Akap4Q60662 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Akap4Q60662 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Akap4Q60662 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Akap4Q60662 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Akap4Q60662 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Akap4Q60662 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Akap4Q60662 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Akap4Q60662 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Akap4Q60662 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Akap4Q60662 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Akap4Q60662 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Akap4Q60662 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Akap4Q60662 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Akap4Q60662 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Akap4Q60662 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Akap4Q60662 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Akap4Q60662 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Akap4Q60662 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Akap4Q60662 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Akap4Q60662 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Akap4Q60662 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Akap4Q60662 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Akap4Q60662 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Akap4Q60662 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Akap4Q60662 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Akap4Q60662 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Akap4Q60662 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Akap4Q60662 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Akap4Q60662 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Akap4Q60662 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Akap4Q60662 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Akap4Q60662 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Akap4Q60662 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Akap4Q60662 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Akap4Q60662 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Akap4Q60662 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Akap4Q60662 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Akap4Q60662 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Akap4Q60662 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Akap4Q60662 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Akap4Q60662 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Akap4Q60662 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Akap4Q60662 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms