Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ECM29Q5VYK3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ECM29Q5VYK3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ECM29Q5VYK3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ECM29Q5VYK3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ECM29Q5VYK3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ECM29Q5VYK3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ECM29Q5VYK3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ECM29Q5VYK3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ECM29Q5VYK3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ECM29Q5VYK3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ECM29Q5VYK3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ECM29Q5VYK3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
ECM29Q5VYK3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
ECM29Q5VYK3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ECM29Q5VYK3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ECM29Q5VYK3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ECM29Q5VYK3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ECM29Q5VYK3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ECM29Q5VYK3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ECM29Q5VYK3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ECM29Q5VYK3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ECM29Q5VYK3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ECM29Q5VYK3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ECM29Q5VYK3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ECM29Q5VYK3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ECM29Q5VYK3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ECM29Q5VYK3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ECM29Q5VYK3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ECM29Q5VYK3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ECM29Q5VYK3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ECM29Q5VYK3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ECM29Q5VYK3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ECM29Q5VYK3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ECM29Q5VYK3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ECM29Q5VYK3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ECM29Q5VYK3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ECM29Q5VYK3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ECM29Q5VYK3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ECM29Q5VYK3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ECM29Q5VYK3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ECM29Q5VYK3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ECM29Q5VYK3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ECM29Q5VYK3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ECM29Q5VYK3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ECM29Q5VYK3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ECM29Q5VYK3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ECM29Q5VYK3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ECM29Q5VYK3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ECM29Q5VYK3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ECM29Q5VYK3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ECM29Q5VYK3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ECM29Q5VYK3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ECM29Q5VYK3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ECM29Q5VYK3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ECM29Q5VYK3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ECM29Q5VYK3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ECM29Q5VYK3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ECM29Q5VYK3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ECM29Q5VYK3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
ECM29Q5VYK3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ECM29Q5VYK3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ECM29Q5VYK3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ECM29Q5VYK3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ECM29Q5VYK3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ECM29Q5VYK3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
ECM29Q5VYK3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ECM29Q5VYK3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ECM29Q5VYK3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ECM29Q5VYK3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ECM29Q5VYK3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ECM29Q5VYK3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ECM29Q5VYK3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ECM29Q5VYK3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ECM29Q5VYK3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ECM29Q5VYK3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ECM29Q5VYK3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ECM29Q5VYK3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ECM29Q5VYK3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ECM29Q5VYK3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms