Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GFI1BQ5VTD9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GFI1BQ5VTD9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GFI1BQ5VTD9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GFI1BQ5VTD9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GFI1BQ5VTD9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms