Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKIV2LQ15477 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKIV2LQ15477 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKIV2LQ15477 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKIV2LQ15477 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SKIV2LQ15477 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKIV2LQ15477 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKIV2LQ15477 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SKIV2LQ15477 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKIV2LQ15477 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKIV2LQ15477 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKIV2LQ15477 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKIV2LQ15477 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKIV2LQ15477 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKIV2LQ15477 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKIV2LQ15477 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SKIV2LQ15477 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SKIV2LQ15477 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKIV2LQ15477 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKIV2LQ15477 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKIV2LQ15477 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKIV2LQ15477 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKIV2LQ15477 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKIV2LQ15477 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKIV2LQ15477 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKIV2LQ15477 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SKIV2LQ15477 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SKIV2LQ15477 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SKIV2LQ15477 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SKIV2LQ15477 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SKIV2LQ15477 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SKIV2LQ15477 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SKIV2LQ15477 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SKIV2LQ15477 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKIV2LQ15477 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKIV2LQ15477 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SKIV2LQ15477 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SKIV2LQ15477 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKIV2LQ15477 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKIV2LQ15477 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SKIV2LQ15477 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SKIV2LQ15477 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKIV2LQ15477 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SKIV2LQ15477 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKIV2LQ15477 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SKIV2LQ15477 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SKIV2LQ15477 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SKIV2LQ15477 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SKIV2LQ15477 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKIV2LQ15477 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKIV2LQ15477 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SKIV2LQ15477 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SKIV2LQ15477 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SKIV2LQ15477 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKIV2LQ15477 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SKIV2LQ15477 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SKIV2LQ15477 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SKIV2LQ15477 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SKIV2LQ15477 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SKIV2LQ15477 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKIV2LQ15477 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKIV2LQ15477 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKIV2LQ15477 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SKIV2LQ15477 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKIV2LQ15477 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKIV2LQ15477 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKIV2LQ15477 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKIV2LQ15477 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKIV2LQ15477 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKIV2LQ15477 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKIV2LQ15477 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKIV2LQ15477 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKIV2LQ15477 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKIV2LQ15477 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms