Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q149G0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q149G0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q149G0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q149G0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Q149G0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Q149G0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q149G0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q149G0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q149G0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q149G0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q149G0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q149G0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q149G0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q149G0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q149G0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q149G0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q149G0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q149G0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q149G0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q149G0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q149G0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q149G0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q149G0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q149G0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q149G0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q149G0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q149G0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q149G0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q149G0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q149G0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q149G0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q149G0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q149G0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q149G0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q149G0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q149G0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q149G0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q149G0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q149G0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q149G0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q149G0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q149G0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q149G0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Q149G0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q149G0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q149G0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q149G0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q149G0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q149G0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q149G0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q149G0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q149G0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q149G0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q149G0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q149G0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q149G0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q149G0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q149G0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q149G0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q149G0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q149G0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q149G0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q149G0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q149G0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q149G0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q149G0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q149G0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q149G0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q149G0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q149G0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Q149G0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q149G0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q149G0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q149G0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q149G0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q149G0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q149G0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q149G0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q149G0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q149G0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q149G0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q149G0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q149G0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q149G0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q149G0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q149G0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q149G0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q149G0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q149G0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q149G0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q149G0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q149G0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q149G0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q149G0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q149G0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q149G0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q149G0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q149G0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q149G0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms