Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAF1BQ13112 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHAF1BQ13112 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHAF1BQ13112 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1BQ13112 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHAF1BQ13112 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHAF1BQ13112 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1BQ13112 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1BQ13112 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHAF1BQ13112 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHAF1BQ13112 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHAF1BQ13112 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1BQ13112 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1BQ13112 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1BQ13112 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1BQ13112 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHAF1BQ13112 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1BQ13112 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1BQ13112 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1BQ13112 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1BQ13112 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHAF1BQ13112 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHAF1BQ13112 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHAF1BQ13112 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHAF1BQ13112 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHAF1BQ13112 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAF1BQ13112 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHAF1BQ13112 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHAF1BQ13112 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHAF1BQ13112 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1BQ13112 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1BQ13112 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1BQ13112 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHAF1BQ13112 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1BQ13112 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1BQ13112 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1BQ13112 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHAF1BQ13112 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHAF1BQ13112 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1BQ13112 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHAF1BQ13112 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1BQ13112 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1BQ13112 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1BQ13112 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHAF1BQ13112 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAF1BQ13112 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAF1BQ13112 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHAF1BQ13112 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1BQ13112 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHAF1BQ13112 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1BQ13112 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1BQ13112 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CHAF1BQ13112 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAF1BQ13112 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHAF1BQ13112 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1BQ13112 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1BQ13112 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHAF1BQ13112 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1BQ13112 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1BQ13112 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1BQ13112 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1BQ13112 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHAF1BQ13112 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1BQ13112 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHAF1BQ13112 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHAF1BQ13112 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1BQ13112 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1BQ13112 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1BQ13112 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1BQ13112 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAF1BQ13112 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAF1BQ13112 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms