Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GTF3C1Q12789 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GTF3C1Q12789 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C1Q12789 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C1Q12789 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C1Q12789 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C1Q12789 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GTF3C1Q12789 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C1Q12789 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GTF3C1Q12789 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C1Q12789 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C1Q12789 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GTF3C1Q12789 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C1Q12789 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GTF3C1Q12789 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GTF3C1Q12789 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C1Q12789 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GTF3C1Q12789 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C1Q12789 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GTF3C1Q12789 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C1Q12789 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GTF3C1Q12789 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GTF3C1Q12789 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GTF3C1Q12789 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C1Q12789 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C1Q12789 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C1Q12789 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C1Q12789 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C1Q12789 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C1Q12789 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GTF3C1Q12789 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
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GTF3C1Q12789 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C1Q12789 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C1Q12789 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C1Q12789 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C1Q12789 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C1Q12789 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C1Q12789 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C1Q12789 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF3C1Q12789 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C1Q12789 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C1Q12789 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF3C1Q12789 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C1Q12789 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF3C1Q12789 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C1Q12789 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C1Q12789 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF3C1Q12789 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF3C1Q12789 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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