Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

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Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
ARHGEF5Q12774 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.85■■■■■ 4.13
ARHGEF5Q12774 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ARHGEF5Q12774 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
ARHGEF5Q12774 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
ARHGEF5Q12774 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.82■■■■■ 4.13
ARHGEF5Q12774 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
ARHGEF5Q12774 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
ARHGEF5Q12774 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
ARHGEF5Q12774 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ARHGEF5Q12774 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ARHGEF5Q12774 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ARHGEF5Q12774 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ARHGEF5Q12774 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
ARHGEF5Q12774 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
ARHGEF5Q12774 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ARHGEF5Q12774 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
ARHGEF5Q12774 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ARHGEF5Q12774 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
ARHGEF5Q12774 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ARHGEF5Q12774 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
ARHGEF5Q12774 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
ARHGEF5Q12774 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ARHGEF5Q12774 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ARHGEF5Q12774 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
ARHGEF5Q12774 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC40.37■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.35■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ARHGEF5Q12774 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
ARHGEF5Q12774 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ARHGEF5Q12774 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ARHGEF5Q12774 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ARHGEF5Q12774 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ARHGEF5Q12774 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
ARHGEF5Q12774 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04
ARHGEF5Q12774 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ARHGEF5Q12774 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms