Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 RET2YFR051C 1641 nt8.78□□□□□ -1
NOP56Q12460 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.77□□□□□ -1.01
NOP56Q12460 UBA4YHR111W 1323 nt8.76□□□□□ -1.01
NOP56Q12460 THI74YDR438W 1113 nt8.75□□□□□ -1.01
NOP56Q12460 POM34YLR018C 900 nt8.75□□□□□ -1.01
NOP56Q12460 PRO1YDR300C 1287 nt8.74□□□□□ -1.01
NOP56Q12460 NAT4YMR069W 858 nt8.74□□□□□ -1.01
NOP56Q12460 SGA1YIL099W 1650 nt8.73□□□□□ -1.01
NOP56Q12460 NDE1YMR145C 1683 nt8.73□□□□□ -1.01
NOP56Q12460 YCR087WYCR087W 516 nt8.73□□□□□ -1.01
NOP56Q12460 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt8.73□□□□□ -1.01
NOP56Q12460 SHH4YLR164W 507 nt8.73□□□□□ -1.01
NOP56Q12460 OPI10YOL032W 741 nt8.73□□□□□ -1.01
NOP56Q12460 ATG15YCR068W 1563 nt8.72□□□□□ -1.01
NOP56Q12460 LAS17YOR181W 1902 nt8.72□□□□□ -1.01
NOP56Q12460 PHO89YBR296C 1725 nt8.71□□□□□ -1.01
NOP56Q12460 SFA1YDL168W 1161 nt8.71□□□□□ -1.02
NOP56Q12460 YSR3YKR053C 1215 nt8.71□□□□□ -1.02
NOP56Q12460 FRT1YOR324C 1809 nt8.7□□□□□ -1.02
NOP56Q12460 UTR1YJR049C 1593 nt8.7□□□□□ -1.02
NOP56Q12460 NBA1YOL070C 1506 nt8.7□□□□□ -1.02 RIP-Chip
NOP56Q12460 KES1YPL145C 1305 nt8.69□□□□□ -1.02
NOP56Q12460 MSF1YPR047W 1410 nt8.69□□□□□ -1.02
NOP56Q12460 ARO8YGL202W 1503 nt8.69□□□□□ -1.02
NOP56Q12460 QDR2YIL121W 1629 nt8.67□□□□□ -1.02 RIP-Chip
NOP56Q12460 MRP20YDR405W 792 nt8.66□□□□□ -1.02 RIP-Chip
NOP56Q12460 PMA2YPL036W 2844 nt8.65□□□□□ -1.02
NOP56Q12460 TOM6YOR045W 186 nt8.65□□□□□ -1.02
NOP56Q12460 BEM1YBR200W 1656 nt8.65□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 YDR306CYDR306C 1437 nt8.64□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 MTG2YHR168W 1557 nt8.64□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 HXT1YHR094C 1713 nt8.63□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 MIM1YOL026C 342 nt8.62□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 CCT2YIL142W 1584 nt8.61□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 DIF1YLR437C 402 nt8.61□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 COQ2YNR041C 1119 nt8.61□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 PUS7YOR243C 2031 nt8.6□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 HIP1YGR191W 1812 nt8.6□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 YGL034CYGL034C 366 nt8.6□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 MET28YIR017C 564 nt8.6□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 TIF6YPR016C 738 nt8.6□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 GGC1YDL198C 903 nt8.59□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 RPL4BYDR012W 1089 nt8.59□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 CSM2YIL132C 642 nt8.59□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 PEX2YJL210W 816 nt8.59□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 UTH1YKR042W 1098 nt8.59□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 RPL4AYBR031W 1089 nt8.59□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 ODC1YPL134C 933 nt8.59□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 AIM45YPR004C 1035 nt8.59□□□□□ -1.03
NOP56Q12460 GND1YHR183W 1470 nt8.58□□□□□ -1.04
NOP56Q12460 ZAP1YJL056C 2643 nt8.58□□□□□ -1.04
NOP56Q12460 XYL2YLR070C 1071 nt8.58□□□□□ -1.04
NOP56Q12460 BET2YPR176C 978 nt8.58□□□□□ -1.04
NOP56Q12460 CCR4YAL021C 2514 nt8.58□□□□□ -1.04
NOP56Q12460 CWC15YDR163W 528 nt8.57□□□□□ -1.04
NOP56Q12460 CTF3YLR381W 2202 nt8.57□□□□□ -1.04
NOP56Q12460 YEL023CYEL023C 2049 nt8.56□□□□□ -1.04
NOP56Q12460 YAR028WYAR028W 705 nt8.55□□□□□ -1.04
NOP56Q12460 HXT10YFL011W 1641 nt8.54□□□□□ -1.04
NOP56Q12460 FIT3YOR383C 615 nt8.54□□□□□ -1.04
NOP56Q12460 HBS1YKR084C 1836 nt8.54□□□□□ -1.04
NOP56Q12460 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt8.52□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 YIL177CYIL177C 5277 nt8.51□□□□□ -1.05 RIP-Chip
NOP56Q12460 STF1YDL130W-A 261 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 NAS6YGR232W 687 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 DBP1YPL119C 1854 nt8.51□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 SED1YDR077W 1017 nt8.49□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 RPS14BYJL191W 417 nt8.49□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 POP2YNR052C 1302 nt8.49□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 GUT1YHL032C 2130 nt8.48□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 DUS3YLR401C 2007 nt8.48□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.48□□□□□ -1.05 RIP-Chip
NOP56Q12460 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.48□□□□□ -1.05 RIP-Chip
NOP56Q12460 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.48□□□□□ -1.05 RIP-Chip
NOP56Q12460 MDM35YKL053C-A 261 nt8.47□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 LIP1YMR298W 453 nt8.47□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 ALP1YNL270C 1722 nt8.46□□□□□ -1.05
NOP56Q12460 SHY1YGR112W 1170 nt8.46□□□□□ -1.06
NOP56Q12460 YIL108WYIL108W 2091 nt8.45□□□□□ -1.06
NOP56Q12460 LSB6YJL100W 1824 nt8.43□□□□□ -1.06 RIP-Chip
NOP56Q12460 AKR2YOR034C 2250 nt8.43□□□□□ -1.06
NOP56Q12460 TSC10YBR265W 963 nt8.42□□□□□ -1.06
NOP56Q12460 TOP3YLR234W 1971 nt8.42□□□□□ -1.06
NOP56Q12460 AIM34YMR003W 597 nt8.41□□□□□ -1.06
NOP56Q12460 PHO23YNL097C 993 nt8.41□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms