Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 NUC1YJL208C 990 nt9.99□□□□□ -0.81
HFI1Q12060 CSM1YCR086W 573 nt9.97□□□□□ -0.81
HFI1Q12060 CCT5YJR064W 1689 nt9.96□□□□□ -0.81
HFI1Q12060 SSN3YPL042C 1668 nt9.96□□□□□ -0.82
HFI1Q12060 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.95□□□□□ -0.82
HFI1Q12060 NAP1YKR048C 1254 nt9.95□□□□□ -0.82
HFI1Q12060 GND2YGR256W 1479 nt9.95□□□□□ -0.82
HFI1Q12060 NAR1YNL240C 1476 nt9.94□□□□□ -0.82
HFI1Q12060 RPT5YOR117W 1305 nt9.94□□□□□ -0.82
HFI1Q12060 SAM2YDR502C 1155 nt9.94□□□□□ -0.82
HFI1Q12060 SEN2YLR105C 1134 nt9.94□□□□□ -0.82
HFI1Q12060 RIB7YBR153W 735 nt9.94□□□□□ -0.82
HFI1Q12060 YJL118WYJL118W 660 nt9.93□□□□□ -0.82
HFI1Q12060 PAU5YFL020C 369 nt9.92□□□□□ -0.82
HFI1Q12060 SHY1YGR112W 1170 nt9.92□□□□□ -0.82
HFI1Q12060 FRE6YLL051C 2139 nt9.91□□□□□ -0.82
HFI1Q12060 TAF13YML098W 504 nt9.91□□□□□ -0.82
HFI1Q12060 PHO23YNL097C 993 nt9.91□□□□□ -0.82
HFI1Q12060 THI72YOR192C 1800 nt9.9□□□□□ -0.82
HFI1Q12060 SEC61YLR378C 1443 nt9.9□□□□□ -0.83
HFI1Q12060 PBP1YGR178C 2169 nt9.9□□□□□ -0.83
HFI1Q12060 BNI5YNL166C 1347 nt9.89□□□□□ -0.83
HFI1Q12060 STP3YLR375W 1032 nt9.88□□□□□ -0.83
HFI1Q12060 PGC1YPL206C 966 nt9.88□□□□□ -0.83
HFI1Q12060 GAL3YDR009W 1563 nt9.88□□□□□ -0.83
HFI1Q12060 URA6YKL024C 615 nt9.87□□□□□ -0.83
HFI1Q12060 MSC1YML128C 1542 nt9.86□□□□□ -0.83
HFI1Q12060 UFO1YML088W 2007 nt9.85□□□□□ -0.83
HFI1Q12060 OXA1YER154W 1209 nt9.85□□□□□ -0.83
HFI1Q12060 OYE3YPL171C 1203 nt9.85□□□□□ -0.83
HFI1Q12060 ZRT3YKL175W 1512 nt9.85□□□□□ -0.83
HFI1Q12060 YBR232CYBR232C 360 nt9.84□□□□□ -0.83
HFI1Q12060 CYT2YKL087C 675 nt9.83□□□□□ -0.84
HFI1Q12060 PET8YNL003C 855 nt9.82□□□□□ -0.84
HFI1Q12060 RAS2YNL098C 969 nt9.81□□□□□ -0.84
HFI1Q12060 SAM3YPL274W 1764 nt9.8□□□□□ -0.84
HFI1Q12060 YER188WYER188W 720 nt9.8□□□□□ -0.84
HFI1Q12060 OYE2YHR179W 1203 nt9.79□□□□□ -0.84
HFI1Q12060 PUP1YOR157C 786 nt9.79□□□□□ -0.84
HFI1Q12060 TPS1YBR126C 1488 nt9.77□□□□□ -0.85
HFI1Q12060 MHF1YOL086W-A 273 nt9.76□□□□□ -0.85
HFI1Q12060 YJL064WYJL064W 396 nt9.75□□□□□ -0.85
HFI1Q12060 YMR262WYMR262W 942 nt9.75□□□□□ -0.85
HFI1Q12060 FUB1YCR076C 753 nt9.74□□□□□ -0.85
HFI1Q12060 POT1YIL160C 1254 nt9.74□□□□□ -0.85
HFI1Q12060 GSF2YML048W 1212 nt9.73□□□□□ -0.85
HFI1Q12060 SNZ1YMR096W 894 nt9.73□□□□□ -0.85
HFI1Q12060 PAR32YDL173W 888 nt9.72□□□□□ -0.85
HFI1Q12060 YPR126CYPR126C 309 nt9.72□□□□□ -0.85
HFI1Q12060 PAU19YMR325W 375 nt9.71□□□□□ -0.86
HFI1Q12060 YNL024CYNL024C 741 nt9.71□□□□□ -0.86
HFI1Q12060 IML3YBR107C 738 nt9.71□□□□□ -0.86
HFI1Q12060 EAF3YPR023C 1206 nt9.7□□□□□ -0.86
HFI1Q12060 DLD2YDL178W 1593 nt9.69□□□□□ -0.86
HFI1Q12060 DAK2YFL053W 1776 nt9.69□□□□□ -0.86
HFI1Q12060 OSH7YHR001W 1314 nt9.69□□□□□ -0.86
HFI1Q12060 CTI6YPL181W 1521 nt9.69□□□□□ -0.86
HFI1Q12060 TIM44YIL022W 1296 nt9.66□□□□□ -0.86
HFI1Q12060 RSC8YFR037C 1674 nt9.66□□□□□ -0.86
HFI1Q12060 YJL067WYJL067W 351 nt9.65□□□□□ -0.86
HFI1Q12060 TUB4YLR212C 1422 nt9.65□□□□□ -0.87
HFI1Q12060 FLR1YBR008C 1647 nt9.64□□□□□ -0.87
HFI1Q12060 TMA23YMR269W 636 nt9.63□□□□□ -0.87
HFI1Q12060 YPS3YLR121C 1527 nt9.62□□□□□ -0.87
HFI1Q12060 YAT1YAR035W 2064 nt9.62□□□□□ -0.87
HFI1Q12060 CWC15YDR163W 528 nt9.62□□□□□ -0.87
HFI1Q12060 LSM5YER146W 282 nt9.62□□□□□ -0.87
HFI1Q12060 SPP2YOR148C 558 nt9.61□□□□□ -0.87
HFI1Q12060 FMS1YMR020W 1527 nt9.61□□□□□ -0.87
HFI1Q12060 SOL2YCR073W-A 948 nt9.6□□□□□ -0.87
HFI1Q12060 DDI1YER143W 1287 nt9.6□□□□□ -0.87
HFI1Q12060 SLG1YOR008C 1137 nt9.59□□□□□ -0.87
HFI1Q12060 IMO32YGR031W 1029 nt9.58□□□□□ -0.88
HFI1Q12060 APS2YJR058C 444 nt9.57□□□□□ -0.88
HFI1Q12060 TIP1YBR067C 633 nt9.57□□□□□ -0.88
HFI1Q12060 VPS62YGR141W 1404 nt9.55□□□□□ -0.88
HFI1Q12060 NIF3YGL221C 867 nt9.53□□□□□ -0.88
HFI1Q12060 SPS100YHR139C 981 nt9.53□□□□□ -0.88
HFI1Q12060 CMP2YML057W 1815 nt9.53□□□□□ -0.88
HFI1Q12060 HEM13YDR044W 987 nt9.52□□□□□ -0.89
HFI1Q12060 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.51□□□□□ -0.89
HFI1Q12060 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.51□□□□□ -0.89
HFI1Q12060 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.51□□□□□ -0.89
HFI1Q12060 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.51□□□□□ -0.89
HFI1Q12060 KRE1YNL322C 942 nt9.51□□□□□ -0.89
HFI1Q12060 ADE8YDR408C 645 nt9.49□□□□□ -0.89
HFI1Q12060 IGD1YFR017C 588 nt9.49□□□□□ -0.89
HFI1Q12060 YDL086WYDL086W 822 nt9.48□□□□□ -0.89
HFI1Q12060 RRT8YOL048C 1029 nt9.48□□□□□ -0.89
HFI1Q12060 RIB1YBL033C 1038 nt9.47□□□□□ -0.89
HFI1Q12060 ACH1YBL015W 1581 nt9.45□□□□□ -0.9
HFI1Q12060 TAT2YOL020W 1779 nt9.45□□□□□ -0.9
HFI1Q12060 YDR455CYDR455C 309 nt9.44□□□□□ -0.9
HFI1Q12060 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.44□□□□□ -0.9
HFI1Q12060 ABZ2YMR289W 1125 nt9.44□□□□□ -0.9
HFI1Q12060 YIA6YIL006W 1122 nt9.43□□□□□ -0.9
HFI1Q12060 ERG13YML126C 1476 nt9.42□□□□□ -0.9
HFI1Q12060 YCR025CYCR025C 411 nt9.42□□□□□ -0.9
HFI1Q12060 RPC82YPR190C 1965 nt9.42□□□□□ -0.9
HFI1Q12060 INA1YLR413W 2028 nt9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.9 ms