Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VIK1Q12045 TOA2YKL058W 369 nt8.98□□□□□ -0.97
VIK1Q12045 PET8YNL003C 855 nt8.98□□□□□ -0.97
VIK1Q12045 QDR2YIL121W 1629 nt8.98□□□□□ -0.97
VIK1Q12045 ALP1YNL270C 1722 nt8.97□□□□□ -0.97
VIK1Q12045 YDR094WYDR094W 336 nt8.97□□□□□ -0.97
VIK1Q12045 FIT3YOR383C 615 nt8.97□□□□□ -0.97
VIK1Q12045 OYE3YPL171C 1203 nt8.97□□□□□ -0.97
VIK1Q12045 BRR1YPR057W 1026 nt8.97□□□□□ -0.97
VIK1Q12045 RPL4BYDR012W 1089 nt8.95□□□□□ -0.98
VIK1Q12045 RPL4AYBR031W 1089 nt8.95□□□□□ -0.98
VIK1Q12045 YPL251WYPL251W 303 nt8.95□□□□□ -0.98
VIK1Q12045 MEP3YPR138C 1470 nt8.94□□□□□ -0.98
VIK1Q12045 ZTA1YBR046C 1005 nt8.93□□□□□ -0.98
VIK1Q12045 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.92□□□□□ -0.98
VIK1Q12045 PAU16YKL224C 372 nt8.91□□□□□ -0.98
VIK1Q12045 GND2YGR256W 1479 nt8.9□□□□□ -0.98
VIK1Q12045 GID8YMR135C 1368 nt8.9□□□□□ -0.98
VIK1Q12045 XYL2YLR070C 1071 nt8.9□□□□□ -0.98
VIK1Q12045 THI72YOR192C 1800 nt8.89□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 DIG1YPL049C 1359 nt8.89□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 AIM45YPR004C 1035 nt8.89□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 SSL2YIL143C 2532 nt8.88□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 VPS62YGR141W 1404 nt8.88□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 RPS14BYJL191W 417 nt8.87□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 MDM35YKL053C-A 261 nt8.87□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 NAT4YMR069W 858 nt8.87□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 SPP2YOR148C 558 nt8.87□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 RFC1YOR217W 2586 nt8.87□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 MSF1YPR047W 1410 nt8.87□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 HEM14YER014W 1620 nt8.87□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 YRF1-2YER190W 5046 nt8.86□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 SAM2YDR502C 1155 nt8.86□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 HXT10YFL011W 1641 nt8.86□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 YDL086WYDL086W 822 nt8.85□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 YGL034CYGL034C 366 nt8.85□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 GAL2YLR081W 1725 nt8.85□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 SBA1YKL117W 651 nt8.84□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 ACH1YBL015W 1581 nt8.84□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 YMR103CYMR103C 363 nt8.84□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 MRS6YOR370C 1812 nt8.84□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 MEX67YPL169C 1800 nt8.84□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 FMS1YMR020W 1527 nt8.84□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 YKL133CYKL133C 1392 nt8.84□□□□□ -0.99
VIK1Q12045 GTB1YDR221W 2109 nt8.82□□□□□ -1
VIK1Q12045 PHO23YNL097C 993 nt8.82□□□□□ -1
VIK1Q12045 SEC61YLR378C 1443 nt8.8□□□□□ -1
VIK1Q12045 YPS3YLR121C 1527 nt8.8□□□□□ -1
VIK1Q12045 LSR1LSR1 1175 nt8.79□□□□□ -1
VIK1Q12045 NBA1YOL070C 1506 nt8.79□□□□□ -1
VIK1Q12045 OXA1YER154W 1209 nt8.78□□□□□ -1
VIK1Q12045 FLR1YBR008C 1647 nt8.77□□□□□ -1.01
VIK1Q12045 TSC10YBR265W 963 nt8.76□□□□□ -1.01
VIK1Q12045 MDL2YPL270W 2322 nt8.75□□□□□ -1.01
VIK1Q12045 DLD2YDL178W 1593 nt8.75□□□□□ -1.01
VIK1Q12045 CWP2YKL096W-A 279 nt8.75□□□□□ -1.01
VIK1Q12045 AGP3YFL055W 1677 nt8.72□□□□□ -1.01
VIK1Q12045 TIM44YIL022W 1296 nt8.72□□□□□ -1.01
VIK1Q12045 YHR219WYHR219W 1875 nt8.72□□□□□ -1.01
VIK1Q12045 YLR279WYLR279W 390 nt8.71□□□□□ -1.02
VIK1Q12045 TOK1YJL093C 2076 nt8.71□□□□□ -1.02
VIK1Q12045 MTO1YGL236C 2010 nt8.7□□□□□ -1.02
VIK1Q12045 APT2YDR441C 546 nt8.7□□□□□ -1.02
VIK1Q12045 RBG1YAL036C 1110 nt8.7□□□□□ -1.02
VIK1Q12045 YER188WYER188W 720 nt8.69□□□□□ -1.02
VIK1Q12045 BNI5YNL166C 1347 nt8.67□□□□□ -1.02
VIK1Q12045 RPD3YNL330C 1302 nt8.66□□□□□ -1.02
VIK1Q12045 HEM13YDR044W 987 nt8.66□□□□□ -1.02
VIK1Q12045 MIM1YOL026C 342 nt8.66□□□□□ -1.02
VIK1Q12045 MSC1YML128C 1542 nt8.65□□□□□ -1.02
VIK1Q12045 YMR262WYMR262W 942 nt8.65□□□□□ -1.02
VIK1Q12045 SDH5YOL071W 489 nt8.65□□□□□ -1.02
VIK1Q12045 RSC4YKR008W 1878 nt8.65□□□□□ -1.02
VIK1Q12045 MSB4YOL112W 1479 nt8.64□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 OSH7YHR001W 1314 nt8.64□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 YGR012WYGR012W 1182 nt8.64□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 FCY21YER060W 1587 nt8.64□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 FUB1YCR076C 753 nt8.63□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.63□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.63□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.63□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.63□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.63□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.63□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.63□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.63□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.63□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.63□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.63□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.63□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.63□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.63□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.63□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 DAK2YFL053W 1776 nt8.62□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 UFD1YGR048W 1086 nt8.6□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 LSB5YCL034W 1065 nt8.6□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 DLD3YEL071W 1491 nt8.59□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 INH1YDL181W 258 nt8.59□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 NUC1YJL208C 990 nt8.59□□□□□ -1.03
VIK1Q12045 YLR046CYLR046C 813 nt8.58□□□□□ -1.04
VIK1Q12045 AIM1YAL046C 357 nt8.57□□□□□ -1.04
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