Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX1Q01196 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RUNX1Q01196 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX1Q01196 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX1Q01196 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUNX1Q01196 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUNX1Q01196 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX1Q01196 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX1Q01196 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX1Q01196 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX1Q01196 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX1Q01196 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX1Q01196 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX1Q01196 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1Q01196 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1Q01196 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX1Q01196 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX1Q01196 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX1Q01196 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX1Q01196 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX1Q01196 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX1Q01196 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX1Q01196 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNX1Q01196 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNX1Q01196 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX1Q01196 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUNX1Q01196 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX1Q01196 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX1Q01196 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX1Q01196 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX1Q01196 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX1Q01196 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUNX1Q01196 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX1Q01196 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RUNX1Q01196 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUNX1Q01196 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RUNX1Q01196 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX1Q01196 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNX1Q01196 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX1Q01196 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNX1Q01196 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX1Q01196 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX1Q01196 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX1Q01196 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNX1Q01196 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX1Q01196 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNX1Q01196 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX1Q01196 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNX1Q01196 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX1Q01196 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX1Q01196 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX1Q01196 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNX1Q01196 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUNX1Q01196 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNX1Q01196 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms