Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2L3P68036 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UBE2L3P68036 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2L3P68036 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2L3P68036 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2L3P68036 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2L3P68036 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
UBE2L3P68036 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2L3P68036 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2L3P68036 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2L3P68036 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBE2L3P68036 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBE2L3P68036 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2L3P68036 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2L3P68036 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBE2L3P68036 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2L3P68036 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBE2L3P68036 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBE2L3P68036 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2L3P68036 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2L3P68036 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2L3P68036 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2L3P68036 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2L3P68036 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2L3P68036 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2L3P68036 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2L3P68036 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2L3P68036 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
UBE2L3P68036 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
UBE2L3P68036 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2L3P68036 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UBE2L3P68036 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms