Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STX1BP61266 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX1BP61266 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STX1BP61266 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STX1BP61266 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STX1BP61266 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STX1BP61266 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STX1BP61266 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STX1BP61266 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STX1BP61266 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STX1BP61266 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STX1BP61266 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STX1BP61266 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STX1BP61266 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STX1BP61266 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STX1BP61266 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
STX1BP61266 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STX1BP61266 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STX1BP61266 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STX1BP61266 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STX1BP61266 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX1BP61266 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX1BP61266 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX1BP61266 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STX1BP61266 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
STX1BP61266 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STX1BP61266 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
STX1BP61266 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STX1BP61266 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STX1BP61266 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STX1BP61266 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX1BP61266 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX1BP61266 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STX1BP61266 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX1BP61266 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX1BP61266 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STX1BP61266 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX1BP61266 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STX1BP61266 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
STX1BP61266 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX1BP61266 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STX1BP61266 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STX1BP61266 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STX1BP61266 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STX1BP61266 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STX1BP61266 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STX1BP61266 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX1BP61266 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX1BP61266 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX1BP61266 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX1BP61266 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX1BP61266 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX1BP61266 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX1BP61266 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX1BP61266 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX1BP61266 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX1BP61266 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX1BP61266 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX1BP61266 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX1BP61266 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX1BP61266 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX1BP61266 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX1BP61266 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX1BP61266 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX1BP61266 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX1BP61266 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
STX1BP61266 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX1BP61266 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX1BP61266 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX1BP61266 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX1BP61266 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX1BP61266 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX1BP61266 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX1BP61266 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX1BP61266 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX1BP61266 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STX1BP61266 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX1BP61266 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX1BP61266 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX1BP61266 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STX1BP61266 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STX1BP61266 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
STX1BP61266 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STX1BP61266 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STX1BP61266 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
STX1BP61266 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STX1BP61266 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1BP61266 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1BP61266 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
STX1BP61266 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1BP61266 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1BP61266 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1BP61266 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1BP61266 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1BP61266 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1BP61266 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
STX1BP61266 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX1BP61266 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STX1BP61266 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STX1BP61266 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms