Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CLDN12P56749 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN12P56749 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN12P56749 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN12P56749 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN12P56749 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN12P56749 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN12P56749 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN12P56749 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN12P56749 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN12P56749 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN12P56749 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN12P56749 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN12P56749 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN12P56749 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN12P56749 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN12P56749 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN12P56749 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN12P56749 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN12P56749 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN12P56749 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN12P56749 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN12P56749 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN12P56749 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN12P56749 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN12P56749 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN12P56749 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN12P56749 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN12P56749 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN12P56749 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN12P56749 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN12P56749 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN12P56749 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN12P56749 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN12P56749 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN12P56749 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN12P56749 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN12P56749 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN12P56749 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN12P56749 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN12P56749 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN12P56749 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN12P56749 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN12P56749 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN12P56749 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN12P56749 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN12P56749 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDN12P56749 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN12P56749 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN12P56749 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN12P56749 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN12P56749 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN12P56749 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN12P56749 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN12P56749 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN12P56749 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN12P56749 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN12P56749 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN12P56749 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN12P56749 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN12P56749 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms