Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC13P55735 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC13P55735 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEC13P55735 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC13P55735 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC13P55735 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC13P55735 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEC13P55735 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC13P55735 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEC13P55735 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC13P55735 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SEC13P55735 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC13P55735 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEC13P55735 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC13P55735 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC13P55735 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEC13P55735 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC13P55735 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC13P55735 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEC13P55735 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC13P55735 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEC13P55735 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC13P55735 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEC13P55735 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEC13P55735 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC13P55735 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC13P55735 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEC13P55735 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEC13P55735 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC13P55735 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEC13P55735 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC13P55735 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEC13P55735 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC13P55735 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC13P55735 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC13P55735 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC13P55735 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC13P55735 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC13P55735 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC13P55735 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC13P55735 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC13P55735 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC13P55735 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC13P55735 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC13P55735 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC13P55735 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC13P55735 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC13P55735 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC13P55735 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC13P55735 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC13P55735 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC13P55735 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC13P55735 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC13P55735 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC13P55735 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC13P55735 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC13P55735 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC13P55735 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC13P55735 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC13P55735 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC13P55735 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC13P55735 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC13P55735 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC13P55735 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC13P55735 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC13P55735 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC13P55735 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC13P55735 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC13P55735 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC13P55735 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC13P55735 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC13P55735 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC13P55735 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC13P55735 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC13P55735 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC13P55735 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC13P55735 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC13P55735 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC13P55735 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC13P55735 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC13P55735 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC13P55735 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC13P55735 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC13P55735 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC13P55735 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC13P55735 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC13P55735 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC13P55735 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC13P55735 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SEC13P55735 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC13P55735 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC13P55735 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC13P55735 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC13P55735 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC13P55735 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC13P55735 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC13P55735 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC13P55735 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC13P55735 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SEC13P55735 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms