Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Psmc4P54775 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Psmc4P54775 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Psmc4P54775 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Psmc4P54775 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Psmc4P54775 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Psmc4P54775 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Psmc4P54775 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Psmc4P54775 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Psmc4P54775 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Psmc4P54775 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Psmc4P54775 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Psmc4P54775 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Psmc4P54775 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Psmc4P54775 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Psmc4P54775 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Psmc4P54775 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Psmc4P54775 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Psmc4P54775 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Psmc4P54775 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Psmc4P54775 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Psmc4P54775 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psmc4P54775 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psmc4P54775 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psmc4P54775 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psmc4P54775 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Psmc4P54775 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Psmc4P54775 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Psmc4P54775 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Psmc4P54775 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Psmc4P54775 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Psmc4P54775 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Psmc4P54775 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Psmc4P54775 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Psmc4P54775 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Psmc4P54775 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Psmc4P54775 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Psmc4P54775 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Psmc4P54775 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Psmc4P54775 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Psmc4P54775 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Psmc4P54775 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Psmc4P54775 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Psmc4P54775 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Psmc4P54775 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Psmc4P54775 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psmc4P54775 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Psmc4P54775 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Psmc4P54775 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Psmc4P54775 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Psmc4P54775 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Psmc4P54775 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Psmc4P54775 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Psmc4P54775 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Psmc4P54775 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Psmc4P54775 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Psmc4P54775 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Psmc4P54775 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Psmc4P54775 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psmc4P54775 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psmc4P54775 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psmc4P54775 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psmc4P54775 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Psmc4P54775 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Psmc4P54775 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Psmc4P54775 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Psmc4P54775 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Psmc4P54775 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Psmc4P54775 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Psmc4P54775 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Psmc4P54775 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Psmc4P54775 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Psmc4P54775 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Psmc4P54775 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Psmc4P54775 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Psmc4P54775 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Psmc4P54775 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Psmc4P54775 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Psmc4P54775 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Psmc4P54775 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Psmc4P54775 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Psmc4P54775 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psmc4P54775 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psmc4P54775 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmc4P54775 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmc4P54775 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmc4P54775 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmc4P54775 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmc4P54775 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmc4P54775 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmc4P54775 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Psmc4P54775 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Psmc4P54775 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Psmc4P54775 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Psmc4P54775 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psmc4P54775 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psmc4P54775 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psmc4P54775 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psmc4P54775 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psmc4P54775 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms