Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HccsP53702 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HccsP53702 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HccsP53702 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HccsP53702 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HccsP53702 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HccsP53702 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HccsP53702 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HccsP53702 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HccsP53702 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HccsP53702 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HccsP53702 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HccsP53702 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HccsP53702 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HccsP53702 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HccsP53702 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HccsP53702 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HccsP53702 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HccsP53702 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HccsP53702 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HccsP53702 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HccsP53702 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HccsP53702 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HccsP53702 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HccsP53702 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HccsP53702 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HccsP53702 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HccsP53702 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HccsP53702 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HccsP53702 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HccsP53702 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HccsP53702 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HccsP53702 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HccsP53702 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HccsP53702 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HccsP53702 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HccsP53702 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HccsP53702 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HccsP53702 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HccsP53702 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HccsP53702 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HccsP53702 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HccsP53702 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HccsP53702 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HccsP53702 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HccsP53702 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HccsP53702 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HccsP53702 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HccsP53702 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HccsP53702 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HccsP53702 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HccsP53702 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HccsP53702 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HccsP53702 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HccsP53702 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HccsP53702 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HccsP53702 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HccsP53702 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HccsP53702 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HccsP53702 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HccsP53702 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HccsP53702 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HccsP53702 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HccsP53702 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HccsP53702 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HccsP53702 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HccsP53702 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HccsP53702 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HccsP53702 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HccsP53702 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HccsP53702 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HccsP53702 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HccsP53702 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HccsP53702 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HccsP53702 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HccsP53702 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HccsP53702 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HccsP53702 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HccsP53702 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HccsP53702 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HccsP53702 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HccsP53702 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HccsP53702 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HccsP53702 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HccsP53702 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HccsP53702 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HccsP53702 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HccsP53702 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HccsP53702 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HccsP53702 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HccsP53702 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HccsP53702 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HccsP53702 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HccsP53702 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HccsP53702 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HccsP53702 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HccsP53702 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HccsP53702 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HccsP53702 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HccsP53702 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms