Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Brca1P48754 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Brca1P48754 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Brca1P48754 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Brca1P48754 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Brca1P48754 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Brca1P48754 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Brca1P48754 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Brca1P48754 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Brca1P48754 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Brca1P48754 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Brca1P48754 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Brca1P48754 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Brca1P48754 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brca1P48754 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brca1P48754 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Brca1P48754 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Brca1P48754 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Brca1P48754 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Brca1P48754 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brca1P48754 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brca1P48754 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brca1P48754 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Brca1P48754 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Brca1P48754 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Brca1P48754 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Brca1P48754 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Brca1P48754 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Brca1P48754 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Brca1P48754 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brca1P48754 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Brca1P48754 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Brca1P48754 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Brca1P48754 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Brca1P48754 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Brca1P48754 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Brca1P48754 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Brca1P48754 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Brca1P48754 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Brca1P48754 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Brca1P48754 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Brca1P48754 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Brca1P48754 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Brca1P48754 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Brca1P48754 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Brca1P48754 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Brca1P48754 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Brca1P48754 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Brca1P48754 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Brca1P48754 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Brca1P48754 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Brca1P48754 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Brca1P48754 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Brca1P48754 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Brca1P48754 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brca1P48754 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Brca1P48754 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Brca1P48754 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Brca1P48754 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Brca1P48754 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Brca1P48754 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Brca1P48754 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Brca1P48754 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Brca1P48754 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Brca1P48754 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brca1P48754 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Brca1P48754 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Brca1P48754 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Brca1P48754 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Brca1P48754 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Brca1P48754 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brca1P48754 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Brca1P48754 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Brca1P48754 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Brca1P48754 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Brca1P48754 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Brca1P48754 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Brca1P48754 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Brca1P48754 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Brca1P48754 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Brca1P48754 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Brca1P48754 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Brca1P48754 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Brca1P48754 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Brca1P48754 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Brca1P48754 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Brca1P48754 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Brca1P48754 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Brca1P48754 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Brca1P48754 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Brca1P48754 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Brca1P48754 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Brca1P48754 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Brca1P48754 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brca1P48754 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Brca1P48754 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brca1P48754 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Brca1P48754 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Brca1P48754 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Brca1P48754 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms