Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSPAN7P41732 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSPAN7P41732 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN7P41732 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN7P41732 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN7P41732 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN7P41732 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN7P41732 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TSPAN7P41732 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN7P41732 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSPAN7P41732 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN7P41732 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN7P41732 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN7P41732 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN7P41732 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN7P41732 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN7P41732 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN7P41732 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN7P41732 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN7P41732 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN7P41732 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN7P41732 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN7P41732 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN7P41732 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN7P41732 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN7P41732 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms