Protein–RNA interactions for Protein: P38844

DSE2, Protein DSE2, yeastyeast

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE2P38844 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt6.47□□□□□ -1.37
DSE2P38844 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt6.47□□□□□ -1.37
DSE2P38844 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt6.47□□□□□ -1.37
DSE2P38844 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt6.47□□□□□ -1.37
DSE2P38844 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt6.47□□□□□ -1.37
DSE2P38844 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt6.47□□□□□ -1.37
DSE2P38844 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt6.47□□□□□ -1.37
DSE2P38844 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt6.47□□□□□ -1.37
DSE2P38844 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt6.47□□□□□ -1.37
DSE2P38844 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt6.47□□□□□ -1.37
DSE2P38844 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt6.47□□□□□ -1.37
DSE2P38844 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt6.47□□□□□ -1.37
DSE2P38844 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt6.47□□□□□ -1.37
DSE2P38844 YER190C-AYER190C-A 576 nt6.45□□□□□ -1.38
DSE2P38844 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt6.45□□□□□ -1.38
DSE2P38844 YML133W-AYML133W-A 576 nt6.45□□□□□ -1.38
DSE2P38844 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt6.45□□□□□ -1.38
DSE2P38844 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt6.45□□□□□ -1.38
DSE2P38844 YPS3YLR121C 1527 nt6.45□□□□□ -1.38
DSE2P38844 DUR3YHL016C 2208 nt6.44□□□□□ -1.38
DSE2P38844 SAM1YLR180W 1149 nt6.44□□□□□ -1.38
DSE2P38844 YMR262WYMR262W 942 nt6.44□□□□□ -1.38
DSE2P38844 TPN1YGL186C 1740 nt6.44□□□□□ -1.38
DSE2P38844 YIL177CYIL177C 5277 nt6.43□□□□□ -1.38
DSE2P38844 FET5YFL041W 1869 nt6.43□□□□□ -1.38
DSE2P38844 YSP3YOR003W 1437 nt6.42□□□□□ -1.38
DSE2P38844 TRT2tT(CGU)K 72 nt6.42□□□□□ -1.38
DSE2P38844 TIM44YIL022W 1296 nt6.41□□□□□ -1.38
DSE2P38844 YAR028WYAR028W 705 nt6.41□□□□□ -1.38
DSE2P38844 BRR1YPR057W 1026 nt6.41□□□□□ -1.38
DSE2P38844 RPD3YNL330C 1302 nt6.41□□□□□ -1.38
DSE2P38844 FLR1YBR008C 1647 nt6.4□□□□□ -1.38
DSE2P38844 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt6.4□□□□□ -1.38
DSE2P38844 YPL251WYPL251W 303 nt6.4□□□□□ -1.38
DSE2P38844 LSB5YCL034W 1065 nt6.4□□□□□ -1.38
DSE2P38844 YRF1-3YGR296W 5580 nt6.39□□□□□ -1.39
DSE2P38844 YRF1-6YNL339C 5580 nt6.39□□□□□ -1.39
DSE2P38844 YRF1-7YPL283C 5580 nt6.39□□□□□ -1.39
DSE2P38844 TOA2YKL058W 369 nt6.39□□□□□ -1.39
DSE2P38844 RIM2YBR192W 1134 nt6.39□□□□□ -1.39
DSE2P38844 DLD3YEL071W 1491 nt6.39□□□□□ -1.39
DSE2P38844 TOM71YHR117W 1920 nt6.38□□□□□ -1.39
DSE2P38844 DUS3YLR401C 2007 nt6.38□□□□□ -1.39
DSE2P38844 SFL1YOR140W 2301 nt6.38□□□□□ -1.39
DSE2P38844 GND2YGR256W 1479 nt6.37□□□□□ -1.39
DSE2P38844 KRR1YCL059C 951 nt6.37□□□□□ -1.39
DSE2P38844 INH1YDL181W 258 nt6.37□□□□□ -1.39
DSE2P38844 MTG2YHR168W 1557 nt6.36□□□□□ -1.39
DSE2P38844 YRF1-1YDR545W 5391 nt6.36□□□□□ -1.39
DSE2P38844 YRF1-5YLR467W 5391 nt6.36□□□□□ -1.39
DSE2P38844 YRF1-8YOR396W 5391 nt6.36□□□□□ -1.39
DSE2P38844 POP2YNR052C 1302 nt6.35□□□□□ -1.39
DSE2P38844 SAM2YDR502C 1155 nt6.35□□□□□ -1.39
DSE2P38844 YNL190WYNL190W 615 nt6.35□□□□□ -1.39
DSE2P38844 TIF6YPR016C 738 nt6.35□□□□□ -1.39
DSE2P38844 DPL1YDR294C 1770 nt6.34□□□□□ -1.39
DSE2P38844 LSM5YER146W 282 nt6.34□□□□□ -1.39
DSE2P38844 OXA1YER154W 1209 nt6.34□□□□□ -1.39
DSE2P38844 PRE6YOL038W 765 nt6.34□□□□□ -1.39
DSE2P38844 DLD2YDL178W 1593 nt6.34□□□□□ -1.39
DSE2P38844 HIP1YGR191W 1812 nt6.34□□□□□ -1.4
DSE2P38844 HEM13YDR044W 987 nt6.33□□□□□ -1.4
DSE2P38844 RPC31YNL151C 756 nt6.33□□□□□ -1.4
DSE2P38844 TOM6YOR045W 186 nt6.33□□□□□ -1.4
DSE2P38844 MET30YIL046W 1923 nt6.33□□□□□ -1.4
DSE2P38844 UTH1YKR042W 1098 nt6.32□□□□□ -1.4
DSE2P38844 ORT1YOR130C 879 nt6.32□□□□□ -1.4
DSE2P38844 YNL115CYNL115C 1935 nt6.32□□□□□ -1.4
DSE2P38844 LAS17YOR181W 1902 nt6.31□□□□□ -1.4
DSE2P38844 ADE16YLR028C 1776 nt6.31□□□□□ -1.4
DSE2P38844 SFA1YDL168W 1161 nt6.29□□□□□ -1.4
DSE2P38844 LEU4YNL104C 1860 nt6.29□□□□□ -1.4
DSE2P38844 SEC61YLR378C 1443 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE2P38844 ENT4YLL038C 744 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE2P38844 YLR046CYLR046C 813 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE2P38844 RTG1YOL067C 534 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE2P38844 VMA11YPL234C 495 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE2P38844 HXT11YOL156W 1704 nt6.28□□□□□ -1.4
DSE2P38844 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt6.27□□□□□ -1.41
DSE2P38844 VPS75YNL246W 795 nt6.27□□□□□ -1.41
DSE2P38844 NPP2YEL016C 1482 nt6.27□□□□□ -1.41
DSE2P38844 AIM1YAL046C 357 nt6.26□□□□□ -1.41
DSE2P38844 MSF1YPR047W 1410 nt6.25□□□□□ -1.41
DSE2P38844 ITR2YOL103W 1830 nt6.25□□□□□ -1.41
DSE2P38844 YMR103CYMR103C 363 nt6.25□□□□□ -1.41
DSE2P38844 PEX25YPL112C 1185 nt6.25□□□□□ -1.41
DSE2P38844 snR4snR4 186 nt6.25□□□□□ -1.41
DSE2P38844 PFS2YNL317W 1398 nt6.24□□□□□ -1.41
DSE2P38844 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt6.24□□□□□ -1.41
DSE2P38844 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt6.24□□□□□ -1.41
DSE2P38844 UBX6YJL048C 1191 nt6.24□□□□□ -1.41
DSE2P38844 AKR2YOR034C 2250 nt6.23□□□□□ -1.41
DSE2P38844 ALP1YNL270C 1722 nt6.23□□□□□ -1.41
DSE2P38844 HXT12YIL170W 1374 nt6.22□□□□□ -1.41
DSE2P38844 TRP2YER090W 1524 nt6.22□□□□□ -1.41
DSE2P38844 PMA2YPL036W 2844 nt6.22□□□□□ -1.41
DSE2P38844 MET28YIR017C 564 nt6.21□□□□□ -1.42
DSE2P38844 PEX2YJL210W 816 nt6.21□□□□□ -1.42
DSE2P38844 FRE6YLL051C 2139 nt6.21□□□□□ -1.42
DSE2P38844 THI6YPL214C 1623 nt6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms