Protein–RNA interactions for Protein: P34243

HCS1, DNA polymerase alpha-associated DNA helicase A, yeastyeast

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCS1P34243 RPS14BYJL191W 417 nt8.89□□□□□ -0.99
HCS1P34243 YPL251WYPL251W 303 nt8.89□□□□□ -0.99
HCS1P34243 BRR1YPR057W 1026 nt8.89□□□□□ -0.99
HCS1P34243 COQ8YGL119W 1506 nt8.89□□□□□ -0.99
HCS1P34243 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.88□□□□□ -0.99
HCS1P34243 YOR325WYOR325W 474 nt8.88□□□□□ -0.99
HCS1P34243 LEU9YOR108W 1815 nt8.87□□□□□ -0.99
HCS1P34243 UFO1YML088W 2007 nt8.87□□□□□ -0.99
HCS1P34243 CYT1YOR065W 930 nt8.86□□□□□ -0.99
HCS1P34243 GND2YGR256W 1479 nt8.85□□□□□ -0.99
HCS1P34243 OYE3YPL171C 1203 nt8.85□□□□□ -0.99
HCS1P34243 RBG1YAL036C 1110 nt8.84□□□□□ -0.99
HCS1P34243 PET8YNL003C 855 nt8.84□□□□□ -0.99
HCS1P34243 MEP3YPR138C 1470 nt8.83□□□□□ -1
HCS1P34243 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.83□□□□□ -1
HCS1P34243 SAM2YDR502C 1155 nt8.82□□□□□ -1
HCS1P34243 SBA1YKL117W 651 nt8.81□□□□□ -1
HCS1P34243 YMR103CYMR103C 363 nt8.8□□□□□ -1
HCS1P34243 ARO8YGL202W 1503 nt8.8□□□□□ -1
HCS1P34243 OPI10YOL032W 741 nt8.78□□□□□ -1
HCS1P34243 TSC10YBR265W 963 nt8.78□□□□□ -1
HCS1P34243 CCT2YIL142W 1584 nt8.78□□□□□ -1
HCS1P34243 SDH5YOL071W 489 nt8.77□□□□□ -1.01
HCS1P34243 DMA2YNL116W 1569 nt8.77□□□□□ -1.01
HCS1P34243 KES1YPL145C 1305 nt8.77□□□□□ -1.01
HCS1P34243 SGA1YIL099W 1650 nt8.76□□□□□ -1.01
HCS1P34243 SPP2YOR148C 558 nt8.76□□□□□ -1.01
HCS1P34243 RSC8YFR037C 1674 nt8.74□□□□□ -1.01
HCS1P34243 BET2YPR176C 978 nt8.73□□□□□ -1.01
HCS1P34243 FMS1YMR020W 1527 nt8.72□□□□□ -1.01
HCS1P34243 YLR279WYLR279W 390 nt8.72□□□□□ -1.01
HCS1P34243 MDL2YPL270W 2322 nt8.72□□□□□ -1.01
HCS1P34243 HEM14YER014W 1620 nt8.7□□□□□ -1.02
HCS1P34243 YGR012WYGR012W 1182 nt8.7□□□□□ -1.02
HCS1P34243 VPS62YGR141W 1404 nt8.7□□□□□ -1.02
HCS1P34243 TPN1YGL186C 1740 nt8.69□□□□□ -1.02
HCS1P34243 SEC61YLR378C 1443 nt8.69□□□□□ -1.02
HCS1P34243 MSB4YOL112W 1479 nt8.69□□□□□ -1.02
HCS1P34243 FLR1YBR008C 1647 nt8.69□□□□□ -1.02
HCS1P34243 YPS3YLR121C 1527 nt8.68□□□□□ -1.02
HCS1P34243 ACH1YBL015W 1581 nt8.66□□□□□ -1.02
HCS1P34243 FRA1YLL029W 2250 nt8.66□□□□□ -1.02
HCS1P34243 DLD2YDL178W 1593 nt8.65□□□□□ -1.02
HCS1P34243 ZAP1YJL056C 2643 nt8.65□□□□□ -1.02
HCS1P34243 YOR072WYOR072W 315 nt8.65□□□□□ -1.02
HCS1P34243 YHR218WYHR218W 1812 nt8.65□□□□□ -1.02
HCS1P34243 YDL086WYDL086W 822 nt8.64□□□□□ -1.03
HCS1P34243 LSB6YJL100W 1824 nt8.64□□□□□ -1.03
HCS1P34243 BNI5YNL166C 1347 nt8.63□□□□□ -1.03
HCS1P34243 OXA1YER154W 1209 nt8.63□□□□□ -1.03
HCS1P34243 QDR2YIL121W 1629 nt8.62□□□□□ -1.03
HCS1P34243 ALR1YOL130W 2580 nt8.61□□□□□ -1.03
HCS1P34243 TOM71YHR117W 1920 nt8.61□□□□□ -1.03
HCS1P34243 YER188WYER188W 720 nt8.61□□□□□ -1.03
HCS1P34243 PCP1YGR101W 1041 nt8.61□□□□□ -1.03
HCS1P34243 GLR1YPL091W 1452 nt8.6□□□□□ -1.03
HCS1P34243 APT2YDR441C 546 nt8.6□□□□□ -1.03
HCS1P34243 FCY21YER060W 1587 nt8.6□□□□□ -1.03
HCS1P34243 DIG1YPL049C 1359 nt8.6□□□□□ -1.03
HCS1P34243 MEX67YPL169C 1800 nt8.59□□□□□ -1.03
HCS1P34243 NUC1YJL208C 990 nt8.58□□□□□ -1.04
HCS1P34243 ODC1YPL134C 933 nt8.58□□□□□ -1.04
HCS1P34243 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.58□□□□□ -1.04
HCS1P34243 RAD23YEL037C 1197 nt8.57□□□□□ -1.04
HCS1P34243 PHO23YNL097C 993 nt8.57□□□□□ -1.04
HCS1P34243 OSH7YHR001W 1314 nt8.56□□□□□ -1.04
HCS1P34243 MSC1YML128C 1542 nt8.56□□□□□ -1.04
HCS1P34243 YLR111WYLR111W 333 nt8.56□□□□□ -1.04
HCS1P34243 FUB1YCR076C 753 nt8.55□□□□□ -1.04
HCS1P34243 HEM13YDR044W 987 nt8.54□□□□□ -1.04
HCS1P34243 PRY1YJL079C 900 nt8.54□□□□□ -1.04
HCS1P34243 SFL1YOR140W 2301 nt8.53□□□□□ -1.04
HCS1P34243 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.53□□□□□ -1.04
HCS1P34243 YRF1-2YER190W 5046 nt8.53□□□□□ -1.04
HCS1P34243 GND1YHR183W 1470 nt8.52□□□□□ -1.05
HCS1P34243 GID8YMR135C 1368 nt8.52□□□□□ -1.05
HCS1P34243 RAS2YNL098C 969 nt8.52□□□□□ -1.05
HCS1P34243 CSM1YCR086W 573 nt8.51□□□□□ -1.05
HCS1P34243 YMR244WYMR244W 1068 nt8.51□□□□□ -1.05
HCS1P34243 LPD1YFL018C 1500 nt8.5□□□□□ -1.05
HCS1P34243 YMR226CYMR226C 804 nt8.5□□□□□ -1.05
HCS1P34243 SMM1YNR015W 1155 nt8.5□□□□□ -1.05
HCS1P34243 LSB5YCL034W 1065 nt8.5□□□□□ -1.05
HCS1P34243 SSL2YIL143C 2532 nt8.49□□□□□ -1.05
HCS1P34243 UFD1YGR048W 1086 nt8.48□□□□□ -1.05
HCS1P34243 AIM1YAL046C 357 nt8.48□□□□□ -1.05
HCS1P34243 RIB3YDR487C 627 nt8.47□□□□□ -1.05
HCS1P34243 MDM35YKL053C-A 261 nt8.47□□□□□ -1.05
HCS1P34243 MRS6YOR370C 1812 nt8.47□□□□□ -1.05
HCS1P34243 HXT10YFL011W 1641 nt8.47□□□□□ -1.05
HCS1P34243 YKL133CYKL133C 1392 nt8.47□□□□□ -1.05
HCS1P34243 SOL2YCR073W-A 948 nt8.46□□□□□ -1.06
HCS1P34243 CAB5YDR196C 726 nt8.45□□□□□ -1.06
HCS1P34243 LOT5YKL183W 921 nt8.45□□□□□ -1.06
HCS1P34243 TAT2YOL020W 1779 nt8.45□□□□□ -1.06
HCS1P34243 YLR046CYLR046C 813 nt8.44□□□□□ -1.06
HCS1P34243 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.44□□□□□ -1.06
HCS1P34243 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.44□□□□□ -1.06
HCS1P34243 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.44□□□□□ -1.06
HCS1P34243 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65.6 ms