Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNA5P22460 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNA5P22460 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNA5P22460 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNA5P22460 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNA5P22460 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNA5P22460 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KCNA5P22460 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNA5P22460 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNA5P22460 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNA5P22460 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNA5P22460 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNA5P22460 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNA5P22460 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNA5P22460 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNA5P22460 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNA5P22460 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNA5P22460 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNA5P22460 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNA5P22460 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNA5P22460 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNA5P22460 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNA5P22460 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNA5P22460 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNA5P22460 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNA5P22460 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNA5P22460 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNA5P22460 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNA5P22460 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNA5P22460 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNA5P22460 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNA5P22460 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA5P22460 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNA5P22460 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA5P22460 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNA5P22460 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNA5P22460 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNA5P22460 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNA5P22460 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNA5P22460 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNA5P22460 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNA5P22460 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNA5P22460 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNA5P22460 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNA5P22460 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNA5P22460 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNA5P22460 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNA5P22460 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNA5P22460 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNA5P22460 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNA5P22460 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNA5P22460 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNA5P22460 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNA5P22460 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNA5P22460 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNA5P22460 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNA5P22460 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNA5P22460 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNA5P22460 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNA5P22460 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNA5P22460 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNA5P22460 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNA5P22460 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNA5P22460 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KCNA5P22460 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KCNA5P22460 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNA5P22460 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNA5P22460 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNA5P22460 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNA5P22460 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNA5P22460 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNA5P22460 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNA5P22460 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNA5P22460 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNA5P22460 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KCNA5P22460 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNA5P22460 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KCNA5P22460 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms