Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TAF1P21675 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
TAF1P21675 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TAF1P21675 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TAF1P21675 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TAF1P21675 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TAF1P21675 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TAF1P21675 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TAF1P21675 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TAF1P21675 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TAF1P21675 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TAF1P21675 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TAF1P21675 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TAF1P21675 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TAF1P21675 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TAF1P21675 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TAF1P21675 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TAF1P21675 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TAF1P21675 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TAF1P21675 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TAF1P21675 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TAF1P21675 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TAF1P21675 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TAF1P21675 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TAF1P21675 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TAF1P21675 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TAF1P21675 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TAF1P21675 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TAF1P21675 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TAF1P21675 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TAF1P21675 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
TAF1P21675 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TAF1P21675 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TAF1P21675 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TAF1P21675 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TAF1P21675 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TAF1P21675 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TAF1P21675 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TAF1P21675 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TAF1P21675 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TAF1P21675 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TAF1P21675 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TAF1P21675 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TAF1P21675 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TAF1P21675 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TAF1P21675 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TAF1P21675 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
TAF1P21675 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
TAF1P21675 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TAF1P21675 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TAF1P21675 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TAF1P21675 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
TAF1P21675 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TAF1P21675 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TAF1P21675 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
TAF1P21675 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
TAF1P21675 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TAF1P21675 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
TAF1P21675 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TAF1P21675 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TAF1P21675 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TAF1P21675 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TAF1P21675 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TAF1P21675 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TAF1P21675 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TAF1P21675 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TAF1P21675 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TAF1P21675 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TAF1P21675 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TAF1P21675 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TAF1P21675 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TAF1P21675 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TAF1P21675 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TAF1P21675 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TAF1P21675 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TAF1P21675 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TAF1P21675 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TAF1P21675 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TAF1P21675 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TAF1P21675 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TAF1P21675 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TAF1P21675 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TAF1P21675 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
TAF1P21675 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TAF1P21675 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TAF1P21675 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TAF1P21675 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TAF1P21675 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TAF1P21675 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TAF1P21675 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TAF1P21675 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TAF1P21675 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TAF1P21675 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TAF1P21675 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TAF1P21675 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TAF1P21675 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TAF1P21675 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TAF1P21675 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TAF1P21675 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TAF1P21675 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms