Protein–RNA interactions for Protein: P19878

NCF2, Neutrophil cytosol factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF2P19878 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NCF2P19878 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCF2P19878 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCF2P19878 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCF2P19878 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCF2P19878 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NCF2P19878 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCF2P19878 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCF2P19878 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCF2P19878 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCF2P19878 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NCF2P19878 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NCF2P19878 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NCF2P19878 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCF2P19878 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCF2P19878 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NCF2P19878 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCF2P19878 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCF2P19878 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NCF2P19878 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCF2P19878 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NCF2P19878 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NCF2P19878 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCF2P19878 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCF2P19878 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCF2P19878 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCF2P19878 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCF2P19878 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCF2P19878 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NCF2P19878 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NCF2P19878 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCF2P19878 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCF2P19878 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCF2P19878 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NCF2P19878 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NCF2P19878 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCF2P19878 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NCF2P19878 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCF2P19878 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NCF2P19878 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCF2P19878 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCF2P19878 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NCF2P19878 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCF2P19878 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCF2P19878 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NCF2P19878 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NCF2P19878 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NCF2P19878 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCF2P19878 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NCF2P19878 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NCF2P19878 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCF2P19878 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NCF2P19878 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCF2P19878 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NCF2P19878 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCF2P19878 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCF2P19878 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCF2P19878 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NCF2P19878 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCF2P19878 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCF2P19878 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCF2P19878 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCF2P19878 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCF2P19878 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCF2P19878 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCF2P19878 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCF2P19878 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCF2P19878 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCF2P19878 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCF2P19878 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCF2P19878 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCF2P19878 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCF2P19878 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCF2P19878 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCF2P19878 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCF2P19878 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCF2P19878 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCF2P19878 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCF2P19878 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCF2P19878 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCF2P19878 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NCF2P19878 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCF2P19878 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCF2P19878 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCF2P19878 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCF2P19878 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCF2P19878 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCF2P19878 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCF2P19878 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCF2P19878 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NCF2P19878 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCF2P19878 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NCF2P19878 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NCF2P19878 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCF2P19878 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCF2P19878 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NCF2P19878 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NCF2P19878 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCF2P19878 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NCF2P19878 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms