Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
VCAM1P19320 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
VCAM1P19320 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
VCAM1P19320 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
VCAM1P19320 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
VCAM1P19320 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
VCAM1P19320 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
VCAM1P19320 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
VCAM1P19320 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
VCAM1P19320 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
VCAM1P19320 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
VCAM1P19320 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
VCAM1P19320 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
VCAM1P19320 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
VCAM1P19320 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
VCAM1P19320 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
VCAM1P19320 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
VCAM1P19320 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
VCAM1P19320 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
VCAM1P19320 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
VCAM1P19320 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
VCAM1P19320 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
VCAM1P19320 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
VCAM1P19320 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
VCAM1P19320 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
VCAM1P19320 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
VCAM1P19320 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
VCAM1P19320 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
VCAM1P19320 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
VCAM1P19320 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
VCAM1P19320 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
VCAM1P19320 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
VCAM1P19320 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
VCAM1P19320 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
VCAM1P19320 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
VCAM1P19320 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
VCAM1P19320 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
VCAM1P19320 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
VCAM1P19320 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
VCAM1P19320 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
VCAM1P19320 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
VCAM1P19320 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
VCAM1P19320 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
VCAM1P19320 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
VCAM1P19320 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
VCAM1P19320 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
VCAM1P19320 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
VCAM1P19320 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
VCAM1P19320 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
VCAM1P19320 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
VCAM1P19320 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
VCAM1P19320 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
VCAM1P19320 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
VCAM1P19320 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
VCAM1P19320 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
VCAM1P19320 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
VCAM1P19320 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
VCAM1P19320 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
VCAM1P19320 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
VCAM1P19320 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
VCAM1P19320 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
VCAM1P19320 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
VCAM1P19320 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
VCAM1P19320 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
VCAM1P19320 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
VCAM1P19320 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
VCAM1P19320 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
VCAM1P19320 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
VCAM1P19320 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
VCAM1P19320 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
VCAM1P19320 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
VCAM1P19320 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
VCAM1P19320 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
VCAM1P19320 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
VCAM1P19320 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
VCAM1P19320 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
VCAM1P19320 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
VCAM1P19320 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
VCAM1P19320 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
VCAM1P19320 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
VCAM1P19320 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
VCAM1P19320 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms