Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GZMBP10144 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GZMBP10144 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GZMBP10144 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GZMBP10144 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GZMBP10144 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GZMBP10144 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GZMBP10144 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GZMBP10144 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GZMBP10144 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GZMBP10144 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GZMBP10144 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GZMBP10144 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GZMBP10144 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GZMBP10144 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GZMBP10144 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GZMBP10144 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GZMBP10144 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GZMBP10144 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GZMBP10144 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GZMBP10144 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GZMBP10144 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GZMBP10144 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GZMBP10144 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GZMBP10144 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GZMBP10144 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GZMBP10144 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GZMBP10144 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GZMBP10144 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GZMBP10144 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GZMBP10144 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GZMBP10144 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GZMBP10144 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GZMBP10144 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GZMBP10144 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GZMBP10144 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GZMBP10144 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GZMBP10144 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GZMBP10144 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GZMBP10144 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GZMBP10144 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GZMBP10144 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GZMBP10144 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GZMBP10144 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GZMBP10144 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GZMBP10144 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GZMBP10144 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GZMBP10144 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GZMBP10144 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GZMBP10144 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GZMBP10144 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GZMBP10144 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GZMBP10144 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GZMBP10144 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GZMBP10144 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GZMBP10144 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GZMBP10144 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GZMBP10144 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GZMBP10144 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GZMBP10144 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GZMBP10144 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GZMBP10144 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GZMBP10144 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GZMBP10144 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GZMBP10144 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GZMBP10144 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GZMBP10144 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GZMBP10144 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GZMBP10144 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GZMBP10144 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GZMBP10144 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GZMBP10144 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GZMBP10144 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GZMBP10144 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GZMBP10144 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GZMBP10144 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GZMBP10144 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GZMBP10144 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GZMBP10144 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GZMBP10144 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GZMBP10144 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GZMBP10144 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GZMBP10144 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GZMBP10144 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GZMBP10144 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GZMBP10144 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GZMBP10144 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GZMBP10144 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GZMBP10144 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GZMBP10144 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GZMBP10144 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GZMBP10144 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GZMBP10144 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GZMBP10144 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GZMBP10144 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GZMBP10144 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GZMBP10144 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GZMBP10144 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GZMBP10144 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GZMBP10144 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms