Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC192P0DO97 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC192P0DO97 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC192P0DO97 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC192P0DO97 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC192P0DO97 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC192P0DO97 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC192P0DO97 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC192P0DO97 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC192P0DO97 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC192P0DO97 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC192P0DO97 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC192P0DO97 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC192P0DO97 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC192P0DO97 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC192P0DO97 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC192P0DO97 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC192P0DO97 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC192P0DO97 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC192P0DO97 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC192P0DO97 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC192P0DO97 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC192P0DO97 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC192P0DO97 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC192P0DO97 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CCDC192P0DO97 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC192P0DO97 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC192P0DO97 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC192P0DO97 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC192P0DO97 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC192P0DO97 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC192P0DO97 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC192P0DO97 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC192P0DO97 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC192P0DO97 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC192P0DO97 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
CCDC192P0DO97 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC192P0DO97 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC192P0DO97 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC192P0DO97 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC192P0DO97 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC192P0DO97 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC192P0DO97 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC192P0DO97 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC192P0DO97 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC192P0DO97 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC192P0DO97 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC192P0DO97 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC192P0DO97 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC192P0DO97 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC192P0DO97 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC192P0DO97 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC192P0DO97 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC192P0DO97 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC192P0DO97 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC192P0DO97 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC192P0DO97 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC192P0DO97 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC192P0DO97 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC192P0DO97 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC192P0DO97 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC192P0DO97 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC192P0DO97 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC192P0DO97 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC192P0DO97 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC192P0DO97 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC192P0DO97 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC192P0DO97 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC192P0DO97 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC192P0DO97 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC192P0DO97 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC192P0DO97 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC192P0DO97 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC192P0DO97 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC192P0DO97 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC192P0DO97 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC192P0DO97 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC192P0DO97 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC192P0DO97 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms