Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMIM10L2AP0DMW4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMIM10L2AP0DMW4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMIM10L2AP0DMW4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMIM10L2AP0DMW4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMIM10L2AP0DMW4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMIM10L2AP0DMW4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMIM10L2AP0DMW4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMIM10L2AP0DMW4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
SMIM10L2AP0DMW4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMIM10L2AP0DMW4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SMIM10L2AP0DMW4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMIM10L2AP0DMW4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMIM10L2AP0DMW4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SMIM10L2AP0DMW4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SMIM10L2AP0DMW4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMIM10L2AP0DMW4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMIM10L2AP0DMW4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMIM10L2AP0DMW4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM10L2AP0DMW4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM10L2AP0DMW4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM10L2AP0DMW4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM10L2AP0DMW4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMIM10L2AP0DMW4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMIM10L2AP0DMW4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMIM10L2AP0DMW4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMIM10L2AP0DMW4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMIM10L2AP0DMW4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMIM10L2AP0DMW4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SMIM10L2AP0DMW4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMIM10L2AP0DMW4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMIM10L2AP0DMW4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMIM10L2AP0DMW4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMIM10L2AP0DMW4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMIM10L2AP0DMW4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMIM10L2AP0DMW4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMIM10L2AP0DMW4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM10L2AP0DMW4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM10L2AP0DMW4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM10L2AP0DMW4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMIM10L2AP0DMW4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMIM10L2AP0DMW4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMIM10L2AP0DMW4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMIM10L2AP0DMW4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMIM10L2AP0DMW4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMIM10L2AP0DMW4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMIM10L2AP0DMW4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMIM10L2AP0DMW4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMIM10L2AP0DMW4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMIM10L2AP0DMW4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMIM10L2AP0DMW4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMIM10L2AP0DMW4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMIM10L2AP0DMW4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMIM10L2AP0DMW4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMIM10L2AP0DMW4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMIM10L2AP0DMW4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMIM10L2AP0DMW4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMIM10L2AP0DMW4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SMIM10L2AP0DMW4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMIM10L2AP0DMW4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMIM10L2AP0DMW4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SMIM10L2AP0DMW4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMIM10L2AP0DMW4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMIM10L2AP0DMW4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMIM10L2AP0DMW4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SMIM10L2AP0DMW4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SMIM10L2AP0DMW4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SMIM10L2AP0DMW4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SMIM10L2AP0DMW4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SMIM10L2AP0DMW4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMIM10L2AP0DMW4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SMIM10L2AP0DMW4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMIM10L2AP0DMW4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM10L2AP0DMW4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM10L2AP0DMW4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM10L2AP0DMW4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMIM10L2AP0DMW4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SMIM10L2AP0DMW4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMIM10L2AP0DMW4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMIM10L2AP0DMW4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms