Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRPB2P08579 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRPB2P08579 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SNRPB2P08579 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNRPB2P08579 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SNRPB2P08579 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNRPB2P08579 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNRPB2P08579 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRPB2P08579 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNRPB2P08579 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPB2P08579 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNRPB2P08579 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SNRPB2P08579 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SNRPB2P08579 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPB2P08579 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SNRPB2P08579 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPB2P08579 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPB2P08579 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPB2P08579 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SNRPB2P08579 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNRPB2P08579 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNRPB2P08579 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRPB2P08579 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNRPB2P08579 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRPB2P08579 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNRPB2P08579 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRPB2P08579 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNRPB2P08579 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPB2P08579 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPB2P08579 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPB2P08579 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNRPB2P08579 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNRPB2P08579 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNRPB2P08579 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPB2P08579 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNRPB2P08579 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRPB2P08579 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNRPB2P08579 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRPB2P08579 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRPB2P08579 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNRPB2P08579 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNRPB2P08579 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRPB2P08579 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRPB2P08579 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRPB2P08579 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNRPB2P08579 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNRPB2P08579 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPB2P08579 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNRPB2P08579 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SNRPB2P08579 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms