Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RHOP08100 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RHOP08100 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RHOP08100 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RHOP08100 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RHOP08100 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RHOP08100 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RHOP08100 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RHOP08100 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RHOP08100 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RHOP08100 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RHOP08100 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RHOP08100 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RHOP08100 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RHOP08100 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RHOP08100 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RHOP08100 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RHOP08100 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RHOP08100 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RHOP08100 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RHOP08100 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RHOP08100 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RHOP08100 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RHOP08100 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RHOP08100 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RHOP08100 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RHOP08100 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RHOP08100 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RHOP08100 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RHOP08100 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RHOP08100 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RHOP08100 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RHOP08100 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RHOP08100 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RHOP08100 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RHOP08100 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RHOP08100 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RHOP08100 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RHOP08100 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RHOP08100 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RHOP08100 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RHOP08100 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RHOP08100 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RHOP08100 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RHOP08100 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RHOP08100 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RHOP08100 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RHOP08100 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHOP08100 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHOP08100 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHOP08100 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHOP08100 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHOP08100 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHOP08100 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RHOP08100 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHOP08100 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHOP08100 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHOP08100 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHOP08100 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RHOP08100 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHOP08100 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RHOP08100 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RHOP08100 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RHOP08100 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RHOP08100 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RHOP08100 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RHOP08100 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHOP08100 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHOP08100 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RHOP08100 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RHOP08100 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RHOP08100 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RHOP08100 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RHOP08100 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RHOP08100 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RHOP08100 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHOP08100 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHOP08100 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHOP08100 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHOP08100 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHOP08100 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHOP08100 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RHOP08100 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RHOP08100 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RHOP08100 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RHOP08100 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOP08100 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOP08100 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOP08100 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RHOP08100 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHOP08100 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHOP08100 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RHOP08100 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHOP08100 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHOP08100 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHOP08100 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHOP08100 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHOP08100 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RHOP08100 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RHOP08100 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms