Protein–RNA interactions for Protein: P06307

CCK, Cholecystokinin, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKP06307 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCKP06307 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKP06307 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKP06307 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCKP06307 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKP06307 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKP06307 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCKP06307 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKP06307 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKP06307 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKP06307 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKP06307 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKP06307 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKP06307 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCKP06307 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCKP06307 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCKP06307 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKP06307 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKP06307 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKP06307 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCKP06307 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKP06307 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKP06307 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKP06307 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCKP06307 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKP06307 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCKP06307 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKP06307 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKP06307 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCKP06307 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKP06307 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKP06307 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKP06307 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCKP06307 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCKP06307 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKP06307 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCKP06307 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCKP06307 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKP06307 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCKP06307 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKP06307 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKP06307 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKP06307 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCKP06307 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKP06307 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKP06307 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKP06307 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCKP06307 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKP06307 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCKP06307 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCKP06307 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKP06307 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKP06307 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKP06307 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCKP06307 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKP06307 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKP06307 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKP06307 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKP06307 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCKP06307 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKP06307 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKP06307 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKP06307 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKP06307 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKP06307 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCKP06307 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKP06307 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKP06307 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKP06307 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCKP06307 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKP06307 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKP06307 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKP06307 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCKP06307 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKP06307 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKP06307 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKP06307 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCKP06307 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCKP06307 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCKP06307 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKP06307 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKP06307 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKP06307 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKP06307 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKP06307 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKP06307 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCKP06307 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKP06307 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKP06307 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKP06307 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKP06307 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKP06307 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKP06307 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKP06307 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKP06307 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKP06307 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKP06307 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKP06307 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKP06307 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKP06307 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms