Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
P04214 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
P04214 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
P04214 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
P04214 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
P04214 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
P04214 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
P04214 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
P04214 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
P04214 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
P04214 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
P04214 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
P04214 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
P04214 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
P04214 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
P04214 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
P04214 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P04214 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
P04214 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
P04214 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
P04214 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
P04214 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
P04214 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
P04214 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
P04214 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
P04214 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
P04214 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
P04214 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
P04214 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
P04214 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
P04214 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
P04214 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
P04214 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
P04214 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
P04214 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
P04214 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
P04214 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
P04214 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
P04214 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
P04214 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P04214 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
P04214 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
P04214 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
P04214 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
P04214 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
P04214 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
P04214 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
P04214 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
P04214 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
P04214 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
P04214 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
P04214 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
P04214 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
P04214 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
P04214 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
P04214 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
P04214 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
P04214 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
P04214 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
P04214 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
P04214 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
P04214 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
P04214 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
P04214 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
P04214 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
P04214 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
P04214 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
P04214 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
P04214 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
P04214 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
P04214 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
P04214 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
P04214 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
P04214 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
P04214 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
P04214 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
P04214 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
P04214 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
P04214 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
P04214 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
P04214 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
P04214 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
P04214 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
P04214 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
P04214 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
P04214 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
P04214 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
P04214 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
P04214 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
P04214 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
P04214 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
P04214 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
P04214 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
P04214 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
P04214 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
P04214 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
P04214 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
P04214 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
P04214 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
P04214 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms