Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA1P02647 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA1P02647 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA1P02647 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA1P02647 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOA1P02647 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA1P02647 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOA1P02647 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA1P02647 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA1P02647 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA1P02647 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA1P02647 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA1P02647 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA1P02647 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA1P02647 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA1P02647 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOA1P02647 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOA1P02647 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOA1P02647 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA1P02647 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA1P02647 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA1P02647 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA1P02647 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA1P02647 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA1P02647 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA1P02647 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA1P02647 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA1P02647 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA1P02647 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA1P02647 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA1P02647 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA1P02647 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA1P02647 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA1P02647 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA1P02647 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA1P02647 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA1P02647 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA1P02647 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOA1P02647 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA1P02647 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA1P02647 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOA1P02647 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOA1P02647 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA1P02647 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA1P02647 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOA1P02647 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOA1P02647 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA1P02647 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOA1P02647 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA1P02647 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA1P02647 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA1P02647 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOA1P02647 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA1P02647 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA1P02647 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOA1P02647 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA1P02647 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA1P02647 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA1P02647 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOA1P02647 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA1P02647 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOA1P02647 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA1P02647 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOA1P02647 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA1P02647 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA1P02647 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA1P02647 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APOA1P02647 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOA1P02647 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA1P02647 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA1P02647 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA1P02647 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA1P02647 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA1P02647 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA1P02647 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA1P02647 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA1P02647 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA1P02647 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA1P02647 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA1P02647 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA1P02647 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA1P02647 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA1P02647 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA1P02647 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA1P02647 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA1P02647 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA1P02647 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA1P02647 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA1P02647 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOA1P02647 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOA1P02647 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA1P02647 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA1P02647 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA1P02647 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA1P02647 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA1P02647 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA1P02647 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA1P02647 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA1P02647 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOA1P02647 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms