Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRPM2O94759 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
TRPM2O94759 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRPM2O94759 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRPM2O94759 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRPM2O94759 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
TRPM2O94759 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRPM2O94759 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
TRPM2O94759 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
TRPM2O94759 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRPM2O94759 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
TRPM2O94759 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
TRPM2O94759 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
TRPM2O94759 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TRPM2O94759 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TRPM2O94759 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
TRPM2O94759 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
TRPM2O94759 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
TRPM2O94759 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
TRPM2O94759 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.09■■■■□ 3.85
TRPM2O94759 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
TRPM2O94759 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
TRPM2O94759 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
TRPM2O94759 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
TRPM2O94759 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
TRPM2O94759 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
TRPM2O94759 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TRPM2O94759 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TRPM2O94759 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TRPM2O94759 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TRPM2O94759 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
TRPM2O94759 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
TRPM2O94759 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
TRPM2O94759 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
TRPM2O94759 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
TRPM2O94759 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TRPM2O94759 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
TRPM2O94759 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
TRPM2O94759 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TRPM2O94759 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TRPM2O94759 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TRPM2O94759 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TRPM2O94759 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TRPM2O94759 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TRPM2O94759 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TRPM2O94759 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TRPM2O94759 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
TRPM2O94759 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TRPM2O94759 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
TRPM2O94759 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TRPM2O94759 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
TRPM2O94759 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
TRPM2O94759 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
TRPM2O94759 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
TRPM2O94759 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
TRPM2O94759 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TRPM2O94759 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TRPM2O94759 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
TRPM2O94759 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
TRPM2O94759 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
TRPM2O94759 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TRPM2O94759 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.87■■■■□ 3.81
TRPM2O94759 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
TRPM2O94759 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
TRPM2O94759 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
TRPM2O94759 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
TRPM2O94759 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
TRPM2O94759 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
TRPM2O94759 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
TRPM2O94759 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
TRPM2O94759 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
TRPM2O94759 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TRPM2O94759 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
TRPM2O94759 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
TRPM2O94759 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
TRPM2O94759 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
TRPM2O94759 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
TRPM2O94759 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
TRPM2O94759 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
TRPM2O94759 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TRPM2O94759 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
TRPM2O94759 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TRPM2O94759 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TRPM2O94759 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TRPM2O94759 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
TRPM2O94759 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
TRPM2O94759 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
TRPM2O94759 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
TRPM2O94759 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TRPM2O94759 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TRPM2O94759 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TRPM2O94759 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
TRPM2O94759 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
TRPM2O94759 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.63■■■■□ 3.78
TRPM2O94759 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
TRPM2O94759 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRPM2O94759 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
TRPM2O94759 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
TRPM2O94759 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
TRPM2O94759 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms