Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30,91■■■□□ 2,54
Setdb1O88974 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Setdb1O88974 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Setdb1O88974 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Setdb1O88974 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Setdb1O88974 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Setdb1O88974 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30,85■■■□□ 2,53
Setdb1O88974 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Setdb1O88974 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Setdb1O88974 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Setdb1O88974 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Setdb1O88974 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Setdb1O88974 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
Setdb1O88974 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30,78■■■□□ 2,52
Setdb1O88974 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Setdb1O88974 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30,76■■■□□ 2,52
Setdb1O88974 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Setdb1O88974 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Setdb1O88974 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Setdb1O88974 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Setdb1O88974 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Setdb1O88974 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Setdb1O88974 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Setdb1O88974 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Setdb1O88974 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Setdb1O88974 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Setdb1O88974 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30,71■■■□□ 2,51
Setdb1O88974 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30,71■■■□□ 2,51
Setdb1O88974 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Setdb1O88974 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30,7■■■□□ 2,5
Setdb1O88974 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Setdb1O88974 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Setdb1O88974 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Setdb1O88974 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Setdb1O88974 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Setdb1O88974 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Setdb1O88974 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30,63■■■□□ 2,49
Setdb1O88974 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30,62■■■□□ 2,49
Setdb1O88974 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Setdb1O88974 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Setdb1O88974 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
Setdb1O88974 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Setdb1O88974 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Setdb1O88974 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Setdb1O88974 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Setdb1O88974 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30,59■■■□□ 2,49
Setdb1O88974 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30,58■■■□□ 2,49
Setdb1O88974 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Setdb1O88974 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Setdb1O88974 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Setdb1O88974 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Setdb1O88974 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
Setdb1O88974 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Setdb1O88974 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Setdb1O88974 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Setdb1O88974 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Setdb1O88974 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Setdb1O88974 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Setdb1O88974 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Setdb1O88974 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Setdb1O88974 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Setdb1O88974 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Setdb1O88974 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Setdb1O88974 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Setdb1O88974 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Setdb1O88974 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Setdb1O88974 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30,46■■■□□ 2,47
Setdb1O88974 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30,46■■■□□ 2,47
Setdb1O88974 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Setdb1O88974 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30,45■■■□□ 2,46
Setdb1O88974 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Setdb1O88974 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Setdb1O88974 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Setdb1O88974 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Setdb1O88974 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30,42■■■□□ 2,46
Setdb1O88974 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Setdb1O88974 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Setdb1O88974 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Setdb1O88974 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Setdb1O88974 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Setdb1O88974 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Setdb1O88974 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Setdb1O88974 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Setdb1O88974 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Setdb1O88974 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Setdb1O88974 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Setdb1O88974 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Setdb1O88974 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Setdb1O88974 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30,35■■■□□ 2,45
Setdb1O88974 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Setdb1O88974 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Setdb1O88974 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Setdb1O88974 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Setdb1O88974 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Setdb1O88974 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Setdb1O88974 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Setdb1O88974 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Setdb1O88974 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Setdb1O88974 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Setdb1O88974 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,2 ms