Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBBP9O75884 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP9O75884 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBBP9O75884 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBBP9O75884 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP9O75884 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP9O75884 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP9O75884 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP9O75884 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP9O75884 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP9O75884 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP9O75884 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP9O75884 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP9O75884 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP9O75884 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP9O75884 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP9O75884 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBBP9O75884 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP9O75884 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RBBP9O75884 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBBP9O75884 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP9O75884 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP9O75884 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBBP9O75884 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP9O75884 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBBP9O75884 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP9O75884 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBBP9O75884 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP9O75884 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBBP9O75884 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBBP9O75884 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP9O75884 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP9O75884 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBBP9O75884 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP9O75884 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP9O75884 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBBP9O75884 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP9O75884 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP9O75884 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBBP9O75884 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP9O75884 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP9O75884 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP9O75884 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP9O75884 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBBP9O75884 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP9O75884 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP9O75884 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RBBP9O75884 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RBBP9O75884 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RBBP9O75884 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RBBP9O75884 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms