Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCM2O75603 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCM2O75603 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCM2O75603 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCM2O75603 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCM2O75603 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCM2O75603 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCM2O75603 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCM2O75603 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCM2O75603 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCM2O75603 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCM2O75603 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCM2O75603 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCM2O75603 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCM2O75603 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCM2O75603 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GCM2O75603 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCM2O75603 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCM2O75603 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCM2O75603 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GCM2O75603 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCM2O75603 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCM2O75603 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCM2O75603 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GCM2O75603 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCM2O75603 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GCM2O75603 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GCM2O75603 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCM2O75603 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCM2O75603 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GCM2O75603 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCM2O75603 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GCM2O75603 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GCM2O75603 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GCM2O75603 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GCM2O75603 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCM2O75603 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCM2O75603 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCM2O75603 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GCM2O75603 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GCM2O75603 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GCM2O75603 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCM2O75603 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GCM2O75603 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCM2O75603 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GCM2O75603 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCM2O75603 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCM2O75603 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCM2O75603 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCM2O75603 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCM2O75603 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCM2O75603 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCM2O75603 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GCM2O75603 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCM2O75603 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCM2O75603 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCM2O75603 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCM2O75603 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCM2O75603 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCM2O75603 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCM2O75603 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCM2O75603 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCM2O75603 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCM2O75603 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GCM2O75603 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCM2O75603 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCM2O75603 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCM2O75603 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCM2O75603 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCM2O75603 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCM2O75603 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCM2O75603 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCM2O75603 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCM2O75603 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCM2O75603 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCM2O75603 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCM2O75603 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GCM2O75603 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCM2O75603 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCM2O75603 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCM2O75603 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCM2O75603 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCM2O75603 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCM2O75603 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCM2O75603 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCM2O75603 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCM2O75603 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCM2O75603 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCM2O75603 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCM2O75603 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCM2O75603 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCM2O75603 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GCM2O75603 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCM2O75603 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCM2O75603 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GCM2O75603 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GCM2O75603 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCM2O75603 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GCM2O75603 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GCM2O75603 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms