Protein–RNA interactions for Protein: O70494

Sp3, Transcription factor Sp3, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp3O70494 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sp3O70494 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sp3O70494 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sp3O70494 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sp3O70494 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sp3O70494 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sp3O70494 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sp3O70494 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sp3O70494 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sp3O70494 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sp3O70494 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sp3O70494 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sp3O70494 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sp3O70494 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sp3O70494 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Sp3O70494 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sp3O70494 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sp3O70494 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sp3O70494 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sp3O70494 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sp3O70494 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sp3O70494 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sp3O70494 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sp3O70494 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sp3O70494 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sp3O70494 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp3O70494 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp3O70494 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp3O70494 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sp3O70494 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp3O70494 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sp3O70494 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp3O70494 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp3O70494 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sp3O70494 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp3O70494 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp3O70494 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp3O70494 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sp3O70494 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp3O70494 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp3O70494 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sp3O70494 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sp3O70494 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp3O70494 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp3O70494 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sp3O70494 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sp3O70494 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sp3O70494 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sp3O70494 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sp3O70494 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sp3O70494 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sp3O70494 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sp3O70494 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sp3O70494 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sp3O70494 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sp3O70494 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sp3O70494 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sp3O70494 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sp3O70494 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sp3O70494 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sp3O70494 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sp3O70494 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sp3O70494 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sp3O70494 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sp3O70494 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sp3O70494 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sp3O70494 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sp3O70494 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sp3O70494 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sp3O70494 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sp3O70494 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sp3O70494 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sp3O70494 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sp3O70494 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sp3O70494 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sp3O70494 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sp3O70494 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sp3O70494 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sp3O70494 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sp3O70494 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sp3O70494 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sp3O70494 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sp3O70494 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp3O70494 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sp3O70494 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sp3O70494 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Sp3O70494 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sp3O70494 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sp3O70494 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sp3O70494 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sp3O70494 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sp3O70494 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sp3O70494 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sp3O70494 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sp3O70494 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sp3O70494 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sp3O70494 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sp3O70494 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sp3O70494 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sp3O70494 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms