Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOL3O60936 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOL3O60936 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOL3O60936 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NOL3O60936 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOL3O60936 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOL3O60936 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOL3O60936 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOL3O60936 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOL3O60936 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOL3O60936 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOL3O60936 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOL3O60936 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOL3O60936 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOL3O60936 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOL3O60936 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOL3O60936 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOL3O60936 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOL3O60936 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOL3O60936 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOL3O60936 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOL3O60936 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOL3O60936 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOL3O60936 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOL3O60936 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOL3O60936 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NOL3O60936 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NOL3O60936 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NOL3O60936 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOL3O60936 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOL3O60936 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOL3O60936 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NOL3O60936 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOL3O60936 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOL3O60936 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOL3O60936 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NOL3O60936 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOL3O60936 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOL3O60936 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NOL3O60936 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOL3O60936 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NOL3O60936 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NOL3O60936 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOL3O60936 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOL3O60936 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NOL3O60936 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOL3O60936 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOL3O60936 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOL3O60936 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOL3O60936 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NOL3O60936 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOL3O60936 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOL3O60936 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOL3O60936 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NOL3O60936 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOL3O60936 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NOL3O60936 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOL3O60936 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOL3O60936 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOL3O60936 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NOL3O60936 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NOL3O60936 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOL3O60936 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOL3O60936 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NOL3O60936 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOL3O60936 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOL3O60936 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NOL3O60936 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NOL3O60936 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOL3O60936 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOL3O60936 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NOL3O60936 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NOL3O60936 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOL3O60936 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOL3O60936 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOL3O60936 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NOL3O60936 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOL3O60936 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NOL3O60936 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NOL3O60936 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOL3O60936 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOL3O60936 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOL3O60936 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOL3O60936 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NOL3O60936 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOL3O60936 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOL3O60936 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOL3O60936 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOL3O60936 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NOL3O60936 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOL3O60936 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOL3O60936 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOL3O60936 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOL3O60936 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NOL3O60936 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOL3O60936 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NOL3O60936 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NOL3O60936 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOL3O60936 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NOL3O60936 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms